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GEDIMAP IDP1790 (個体群)
個体群名Kit03
魚種アカメ Lates japonicus (アカメ科) fish base BOLD
場所宮崎県 (北川水系)
解析領域CR (879 bp)
環境情報汽水
移植状況自然分布
出典Takahashi, H., N. Takeshita, H. Tanoue, S.Ueda, H. Takeshima, T. Komatsu, I. Kinoshita and M. Nishida (2015) Severely depleted genetic diversity and population structure of a large predatory marine fish (Lates japonicus) endemic to Japan. Conserv. Genet. GEDIMAPR562
多様度指数A:3, ne:1.41, h:0.3182, SE_h:0.1637, pi:0.001224, SE_pi:0.028099

HapJ1 = [ GEDIMAPH3052 ] ; HapJ2 = [ GEDIMAPH3053 ] ; HapJ3 = [ GEDIMAPH3054 ]
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GEDIMAP IDP1789 (個体群)
個体群名Kit02
魚種アカメ Lates japonicus (アカメ科) fish base BOLD
場所宮崎県 (北川水系)
解析領域CR (879 bp)
環境情報汽水
移植状況自然分布
出典Takahashi, H., N. Takeshita, H. Tanoue, S.Ueda, H. Takeshima, T. Komatsu, I. Kinoshita and M. Nishida (2015) Severely depleted genetic diversity and population structure of a large predatory marine fish (Lates japonicus) endemic to Japan. Conserv. Genet. GEDIMAPR562
多様度指数A:3, ne:2.67, h:0.6818, SE_h:0.0910, pi:0.002327, SE_pi:0.038761

HapJ1 = [ GEDIMAPH3052 ] ; HapJ2 = [ GEDIMAPH3053 ] ; HapJ3 = [ GEDIMAPH3054 ]
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GEDIMAP IDP1649 (個体群)
個体群名C_matsubarae_Miyazaki_Oyodo
魚種ヤマトシマドジョウ Cobitis matsubarae (ドジョウ科) fish base BOLD
場所宮崎県 西諸県郡 (大淀川水系)
解析領域cyt_b (725 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典中島 淳・中村朋史・洲澤 譲 (2011) 宮崎県大淀川水系から得られた特異なシマドジョウ属. 魚類学雑誌, 58: 153-160 GEDIMAPR517
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.001379, SE_pi:0.000000

Oyodo-01 = [ GEDIMAPH2792, DDBJAB602790 ] ; Oyodo-02 = [ GEDIMAPH2793, DDBJAB613824 ]
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GEDIMAP IDP1238 (個体群)
個体群名L_petersii_Miyazaki_16_KD
魚種シロウオ Leucopsarion petersii (ハゼ科) fish base BOLD
場所宮崎県 門川 (五十鈴川水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報汽水
移植状況自然分布
出典Kokita, T. and K. Nohara (2011) Phylogeography and historical demography of the anadromous fish Leucopsarion petersii in relation to geological history and oceanography around the Japanese Archipelago. Molecular Ecology, 20: 143-164. GEDIMAPR431
多様度指数A:5, ne:5.00, h:1.0000, SE_h:0.1265, pi:0.009027, SE_pi:0.000000

H54 = [ GEDIMAPH1925, DDBJAB562209 ] ; H55 = [ GEDIMAPH1926, DDBJAB562210 ] ; H56 = [ GEDIMAPH1927, DDBJAB562211 ] ; H57 = [ GEDIMAPH1928, DDBJAB562212 ] ; H58 = [ GEDIMAPH1929, DDBJAB562213 ]
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GEDIMAP IDP1013 (個体群)
個体群名T_hakonensis_Miyazaki_Oyodo
魚種ウグイ Tribolodon hakonensis (コイ科) fish base BOLD
場所宮崎県 (大淀川水系)
解析領域cyt_b, CR (1788 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Sasaki, T., Y. P. Kartavtsev, S. N. Chiba, T. Uematsu, V. V. Sviridov and N. Hanzawa (2007) Genetic divergence and phylogenetic independence of Far Eastern species in subfamily Leuciscinae (Pisces: Cyprinidae) inferred from mitochondrial DNA analyses. Genes Genet. Syst., 82: 329-340. GEDIMAPR369
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Th_OYO = [ GEDIMAPH1328, DDBJAB198958,AB207003 ]
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GEDIMAP IDP704 (個体群)
個体群名M_salmoides_Miyazaki_Komaru_46_Mz-3
魚種オオクチバス Micropterus salmoides (サンフィッシュ科) fish base BOLD
場所宮崎県 (小丸川水系)
解析領域CR (294 bp)
環境情報河川下流
移植状況外来種である(国外移入)
出典高村健二 (2005) 日本産ブラックバスにおけるミトコンドリアDNAハプロタイプの分布. 魚類学雑誌,52:107−114 GEDIMAPR235
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

h_AB190245 = [ GEDIMAPH1060, DDBJAB190245 ]
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GEDIMAP IDP337 (個体群)
個体群名L_guttatus_Kagoshima_MInamiosumi
魚種ミミズハゼ Luciogobius guttatus (ハゼ科) fish base BOLD
場所鹿児島県 南大隅町 間泊 (小丸川水系)
解析領域12S_rRNA, 16S_rRNA (1252 bp)
環境情報汽水
移植状況自然分布
出典向井貴彦・西田 睦 (2004) 日本産ミミズハゼにおけるミトコンドリアDNAの系統と地理的分化. 魚類学雑誌,51:157?161 GEDIMAPR217
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

LgMadomari = [ GEDIMAPH518, DDBJAB108559,AB108569 ]
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GEDIMAP IDP50 (個体群)
個体群名P_aurantiacus_Miyazaki_Uranona_50
魚種アリアケギバチ Pseudobagrus aurantiacus (ギギ科) fish base BOLD
場所宮崎県 高岡町 (大淀川水系)
解析領域CR (420 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Watanabe, K. and M. Nishida (2003) Genetic population structure of Japanese bagrid catfishes. Ichthyol. Res., 50: 301-309 GEDIMAPR197
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

P = [ GEDIMAPH96 ]
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GEDIMAP IDP27 (個体群)
個体群名P_oxycephalus_jouyi_Miyazaki_27
魚種タカハヤ Phoxinus oxycephalus jouyi (コイ科) fish base BOLD
場所宮崎県 (大淀川水系)
解析領域CR (442 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典樋口文夫・渡辺勝敏 (2005) 横浜市を流れる河川におけるアブラハヤの遺伝的多様性と交雑. 魚類学雑誌,52:41-46 GEDIMAPR227
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.002262, SE_pi:0.000000

O1 = [ GEDIMAPH60, DDBJAB185412 ] ; O2 = [ GEDIMAPH61 ]

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