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GEDIMAP IDP2244 (個体群)
個体群名T_hakonensis_32_Minami
魚種ウグイ Tribolodon hakonensis (コイ科) fish base BOLD
場所福井県 (南川水系)
解析領域cyt_b (758 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., H. Sakai, T. Sanada and M. Nishida (2018) Comparative phylogeography of diadromous and freshwater daces of the genus Tribolodon (Cyprinidae). Ichthyol Res., 65 GEDIMAPR603
多様度指数A:2, ne:1.34, h:0.2684, SE_h:0.1133, pi:0.000354, SE_pi:0.012350

h28 = [ GEDIMAPH3886, DDBJLC277560 ] ; h29 = [ GEDIMAPH3887, DDBJLC277559 ]
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GEDIMAP IDP2243 (個体群)
個体群名T_hakonensis_31_Kita
魚種ウグイ Tribolodon hakonensis (コイ科) fish base BOLD
場所福井県 (北川水系)
解析領域cyt_b (758 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., H. Sakai, T. Sanada and M. Nishida (2018) Comparative phylogeography of diadromous and freshwater daces of the genus Tribolodon (Cyprinidae). Ichthyol Res., 65 GEDIMAPR603
多様度指数A:4, ne:2.47, h:0.6263, SE_h:0.0839, pi:0.001229, SE_pi:0.023015

h27 = [ GEDIMAPH3885, DDBJLC277574 ] ; h28 = [ GEDIMAPH3886, DDBJLC277560 ] ; h29 = [ GEDIMAPH3887, DDBJLC277559 ] ; h30 = [ GEDIMAPH3888, DDBJLC277558 ]
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GEDIMAP IDP1907 (個体群)
個体群名O_platypus_Hyogo_Hatta
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 (由良川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR576
多様度指数A:4, ne:3.57, h:0.9000, SE_h:0.1610, pi:0.003785, SE_pi:0.000000

WJ03 = [ GEDIMAPH3112, DDBJLC019795 ] ; WJ11 = [ GEDIMAPH3120, DDBJLC019803 ] ; WJ38 = [ GEDIMAPH3147, DDBJLC019830 ] ; WJ40 = [ GEDIMAPH3149, DDBJLC019832 ]
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GEDIMAP IDP1825 (個体群)
個体群名L_reini_Fukui_Minami_28
魚種アカザ Liobagrus reini (アカザ科) fish base BOLD
場所福井県 (南川水系)
解析領域cyt_b (580 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Nakagawa, N., S. Seki, T. Ishikawa and K. Watanabe (2015) Genetic population structure of the Japanese torrent catfish Liobagrus reinii (Amblycipitidae) inferred from mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res. GEDIMAPR568
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

H44 = [ GEDIMAPH3099, DDBJLC064987 ]
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GEDIMAP IDP1823 (個体群)
個体群名L_reini_Kyoto_Yura_26
魚種アカザ Liobagrus reini (アカザ科) fish base BOLD
場所京都府 美山町芦生 (由良川水系)
解析領域cyt_b (580 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Nakagawa, N., S. Seki, T. Ishikawa and K. Watanabe (2015) Genetic population structure of the Japanese torrent catfish Liobagrus reinii (Amblycipitidae) inferred from mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res. GEDIMAPR568
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

H50 = [ GEDIMAPH3105, DDBJLC064989 ]
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GEDIMAP IDP1757 (個体群)
個体群名A_cyanostigma_Kyoto_Maruyama_12
魚種イチモンジタナゴ Acheilognathus cyanostigma (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 豊岡 (円山川水系)
解析領域cyt_b (1113 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Kitazima, J., M. Matsuda, S. Mori, T. Kokita and K. Watanabe (2014) Population structure and cryptic replacement of local populations in the endangered bitterling Acheilognathus cyanostigma. GEDIMAPR547
多様度指数A:3, ne:2.00, h:0.5238, SE_h:0.1055, pi:0.000522, SE_pi:0.014809

h01 = [ GEDIMAPH2919, DDBJAB819565 ] ; h02 = [ GEDIMAPH2920, DDBJAB819566 ] ; h07 = [ GEDIMAPH2925, DDBJAB819571 ]
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GEDIMAP IDP1756 (個体群)
個体群名A_cyanostigma_Kyoto_Yura_11
魚種イチモンジタナゴ Acheilognathus cyanostigma (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 綾部 (由良川水系)
解析領域cyt_b (1113 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Kitazima, J., M. Matsuda, S. Mori, T. Kokita and K. Watanabe (2014) Population structure and cryptic replacement of local populations in the endangered bitterling Acheilognathus cyanostigma. GEDIMAPR547
多様度指数A:2, ne:1.80, h:0.6667, SE_h:0.3143, pi:0.005391, SE_pi:0.000000

h08 = [ GEDIMAPH2926, DDBJAB819572 ] ; h11 = [ GEDIMAPH2929, DDBJAB819575 ]
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GEDIMAP IDP1700 (個体群)
個体群名S_variegatus_variegatus_Toyooka_Maruyama
魚種カワヒガイ Sarcocheilichthys variegatus variegatus (コイ科) fish base BOLD
場所兵庫県 豊岡市 (円山川水系)
解析領域cyt_b (620 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Komiya, T., S. Fujita-Yanagibayashi and K. Watanabe (2013) Multiple colonizations of Lake Biwa by Sarcocheilichthys fishes and their population history. Environ. Biol. Fish. DOI 10.1007/s10641-013-0176-9 GEDIMAPR539
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

B004 = [ GEDIMAPH2861, DDBJAB780984 ]
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GEDIMAP IDP1698 (個体群)
個体群名S_variegatus_variegatus_Ayabe_Yura
魚種カワヒガイ Sarcocheilichthys variegatus variegatus (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 綾部市 (由良川水系)
解析領域cyt_b (620 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Komiya, T., S. Fujita-Yanagibayashi and K. Watanabe (2013) Multiple colonizations of Lake Biwa by Sarcocheilichthys fishes and their population history. Environ. Biol. Fish. DOI 10.1007/s10641-013-0176-9 GEDIMAPR539
多様度指数A:6, ne:4.55, h:0.8211, SE_h:0.0535, pi:0.007827, SE_pi:0.058208

A001 = [ GEDIMAPH2031, DDBJAB601449 ] ; B001 = [ GEDIMAPH2860, DDBJAB780983 ] ; C001 = [ GEDIMAPH2050, DDBJAB601468 ] ; D001 = [ GEDIMAPH2868, DDBJAB780991 ] ; D002 = [ GEDIMAPH2869, DDBJAB780992 ] ; D003 = [ GEDIMAPH2870, DDBJAB780993 ]
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GEDIMAP IDP1462 (個体群)
個体群名G_urotaenia_Kyoto_Fukuchiyama
魚種ウキゴリ Gymnogobius urotaenia (ハゼ科) fish base BOLD
場所京都府 福知山市 (由良川水系)
解析領域cyt_b (625 bp)
環境情報河川下流
移植状況自然分布
出典Tabata, R. and K. Watanabe (2012) Hidden mitochondrial DNA divergence in the Lake Biwa endemic goby Gymnogobius isaza: implications for its evolutionary history. Environ. Biol. Fish. GEDIMAPR488
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

UR12 = [ GEDIMAPH2427, DDBJAB685557 ]
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GEDIMAP IDP1442 (個体群)
個体群名C_pollux_ME_13
魚種カジカ類 Cottus sp. (カジカ科) fish base BOLD
場所福井県 (南川水系)
解析領域CR (387 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Tsukagoshi, H., R. Yokoyama and A. Goto (2011) Mitochondrial DNA analysis reveals a unique population structure of the amphidromous sculpin Cottus pollux middle-egg type (Teleostei: Cottidae). Mol. Phylogenet. Evol., 60: 265-270. GEDIMAPR486
多様度指数A:2, ne:1.10, h:0.0952, SE_h:0.0843, pi:0.000246, SE_pi:0.010167

M47 = [ GEDIMAPH2352, DDBJAB605422 ] ; M6 = [ GEDIMAPH2332, DDBJAB605401 ]
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GEDIMAP IDP1441 (個体群)
個体群名C_pollux_ME_12
魚種カジカ類 Cottus sp. (カジカ科) fish base BOLD
場所福井県 (北川水系)
解析領域CR (387 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Tsukagoshi, H., R. Yokoyama and A. Goto (2011) Mitochondrial DNA analysis reveals a unique population structure of the amphidromous sculpin Cottus pollux middle-egg type (Teleostei: Cottidae). Mol. Phylogenet. Evol., 60: 265-270. GEDIMAPR486
多様度指数A:3, ne:1.36, h:0.2789, SE_h:0.1235, pi:0.000748, SE_pi:0.017952

M43 = [ GEDIMAPH2354, DDBJAB605424 ] ; M47 = [ GEDIMAPH2352, DDBJAB605422 ] ; M51 = [ GEDIMAPH2348, DDBJAB605418 ]
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GEDIMAP IDP1414 (個体群)
個体群名G_elongatus_elongatus_Kyoto_Takaya
魚種タモロコ Gnathopogon elongatus elongatus (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 瑞穂町 (由良川水系)
解析領域cyt_b (598 bp)
環境情報河川中流
移植状況不明
出典Kakioka R, Kokita T, Tabata R, Mori S, Watanabe K (2012) The origins of limnetic forms and cryptic divergence in Gnathopogon fishes (Cyprinidae) in Japan. Environ. Biol. Fish. GEDIMAPR485
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

e1_26 = [ GEDIMAPH2264, DDBJAB677369 ]
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GEDIMAP IDP1413 (個体群)
個体群名G_elongatus_elongatus_Fukui_Obama
魚種タモロコ Gnathopogon elongatus elongatus (コイ科) fish base BOLD
場所福井県 小浜市 (北川水系)
解析領域cyt_b (598 bp)
環境情報河川下流
移植状況移植個体群である可能性が高い(国内移入)
出典Kakioka R, Kokita T, Tabata R, Mori S, Watanabe K (2012) The origins of limnetic forms and cryptic divergence in Gnathopogon fishes (Cyprinidae) in Japan. Environ. Biol. Fish. GEDIMAPR485
多様度指数A:2, ne:1.88, h:0.5357, SE_h:0.1232, pi:0.007167, SE_pi:0.100509

e2_1 = [ GEDIMAPH2288, DDBJAB677393 ] ; e2_18 = [ GEDIMAPH2305, DDBJAB677410 ]
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GEDIMAP IDP974 (個体群)
個体群名O_latipes_Hyogo_Toyooka1
魚種メダカ Oryzias latipes (メダカ科) fish base BOLD
場所兵庫県 豊岡市 (円山川水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Takehana, Y., N. Nagai, M. Matsuda, K. Tsuchiya, and M. Sakaizumi (2003) Geographic variation and diversity of the cytochrome b gene in Japanese wild populations of medaka, Oryzias latipes. Zool. Sci., 20: 1279-1291 GEDIMAPR199
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

A14_Toyoo1 = [ GEDIMAPH1450, DDBJAB084686 ]
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GEDIMAP IDP972 (個体群)
個体群名O_latipes_Kyoto_Tamba
魚種メダカ Oryzias latipes (メダカ科) fish base BOLD
場所京都府 船井郡京丹波町(旧丹波町) (由良川水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Takehana, Y., N. Nagai, M. Matsuda, K. Tsuchiya, and M. Sakaizumi (2003) Geographic variation and diversity of the cytochrome b gene in Japanese wild populations of medaka, Oryzias latipes. Zool. Sci., 20: 1279-1291 GEDIMAPR199
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

B38_Tanba = [ GEDIMAPH1505, DDBJAB084743 ]
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GEDIMAP IDP837 (個体群)
個体群名P_esocinus_esocinus_Kyoto_Nantan_WB-1
魚種カマツカ Pseudogobio esocinus esocinus (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 南丹市 (由良川水系)
解析領域cyt_b (689 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Tominaga, K., K. Watanabe, R. Kakioka, S. Mori and S-R. Jeon (2009) Two highly divergent mitochondrial DNA lineages within Pseudogobio esocinus populations in central Honshu, Japan. Ichthyol. Res., 56: 195-199. GEDIMAPR345
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.007257, SE_pi:0.000000

1Bw14 = [ GEDIMAPH1255, DDBJAB426302 ] ; 1Bw15 = [ GEDIMAPH1256, DDBJAB426303 ]
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GEDIMAP IDP719 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_Shiga_Amasu
魚種イワナ類 Salvelinus leucomaenis (サケ科) fish base BOLD
場所滋賀県 (北川水系)
解析領域cyt_b (525 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Kikko, T., M. Kuwahara, K. Iguchi, S. Kurumi, S. Yamamoto, Y. Kai and K. Nakayama (2008) Mitochondrial DNA population structure of the white-spotted charr (Salvelinus leucomaenis) in the Lake Biwa water system. Zool. Sci., 25: 146-153 GEDIMAPR311
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap_19_K08 = [ GEDIMAPH1143 ]
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GEDIMAP IDP586 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_pluvius_Hyogo_Maruyama_PU-11
魚種ニッコウイワナ Salvelinus leucomaenis pluvius (サケ科) fish base BOLD
場所兵庫県 (円山川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Yamamoto, S., K. Morita, S. Kitano, K. Watanabe, I. Koizumi, K. Maekawa and K. Takamura (2004) Phylogeography of white-spotted charr (Salvelinus leucomaenis) inferred from mitochondrial DNA sequences. Zool. Sci. 21: 229-240 GEDIMAPR213
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap1 = [ GEDIMAPH552, DDBJAB111031 ]
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GEDIMAP IDP250 (個体群)
個体群名L_sp__Fukui_Nadasho
魚種ナガレホトケドジョウ Lefua sp. (タニノボリ科) fish base BOLD
場所福井県 名田庄 (南川水系)
解析領域CR (955 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Sakai, T., M. Mihara, H. Shitara, H. Yonekawa, K. Hosoya and J. Miyazaki (2003) Phylogenetic relationships and intraspecific variations of loaches of the genus Lefua (Balitoridae, Cypriniformes). Zool. Sci., 20: 501-514 GEDIMAPR196
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

NadashoLsp = [ GEDIMAPH289, DDBJAB102818 ]

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