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GEDIMAP IDP2204 (個体群)
個体群名T_brandtii_16_Oyabe
魚種マルタ Tribolodon brandtii (コイ科) fish base BOLD
場所富山県 (小矢部川水系)
解析領域cyt_b (758 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., H. Sakai, T. Sanada and M. Nishida (2018) Comparative phylogeography of diadromous and freshwater daces of the genus Tribolodon (Cyprinidae). Ichthyol Res., 65 GEDIMAPR603
多様度指数A:4, ne:2.08, h:0.5833, SE_h:0.1833, pi:0.001173, SE_pi:0.034645

bb01 = [ GEDIMAPH3825, DDBJLC277312 ] ; bb03 = [ GEDIMAPH3827, DDBJLC277316 ] ; bb04 = [ GEDIMAPH3828, DDBJLC277315 ] ; bb05 = [ GEDIMAPH3829, DDBJLC277320 ]
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GEDIMAP IDP1859 (個体群)
個体群名O_platypus_Fukui_Kuzuryu
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所福井県 (九頭竜川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況不明
出典 未発表データ: GEDIMAPR574
多様度指数A:6, ne:6.00, h:1.0000, SE_h:0.0962, pi:0.007769, SE_pi:0.000000

WJ107 = [ GEDIMAPH3215, DDBJLC019899 ] ; WJ110 = [ GEDIMAPH3218, DDBJLC019902 ] ; WJ44 = [ GEDIMAPH3153, DDBJLC019836 ] ; WJ62 = [ GEDIMAPH3171, DDBJLC019854 ] ; WJ83 = [ GEDIMAPH3192, DDBJLC019875 ] ; WJ95 = [ GEDIMAPH3203, DDBJLC019887 ]
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GEDIMAP IDP1801 (個体群)
個体群名L_reini_Gifu_Jinzu_8
魚種アカザ Liobagrus reini (アカザ科) fish base BOLD
場所岐阜県 国府町 (神通川水系)
解析領域cyt_b (580 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Nakagawa, N., S. Seki, T. Ishikawa and K. Watanabe (2015) Genetic population structure of the Japanese torrent catfish Liobagrus reinii (Amblycipitidae) inferred from mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res. GEDIMAPR568
多様度指数A:3, ne:2.27, h:0.7000, SE_h:0.2184, pi:0.002069, SE_pi:0.000000

H14 = [ GEDIMAPH3069, DDBJLC064939,LC064940,LC064941 ] ; H15 = [ GEDIMAPH3070, DDBJLC064970 ] ; H28 = [ GEDIMAPH3083, DDBJLC064979 ]
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GEDIMAP IDP1717 (個体群)
個体群名C_sp_middle_egg_type_Ishikawa_DS
魚種カジカ(生態型不明) Cottus sp. (カジカ科) fish base BOLD
場所石川県 (大聖寺川水系)
解析領域CR (387 bp)
環境情報河川下流
移植状況自然分布
出典Tsukagoshi, H., K. Sakai, K. Yamamoto and A. Goto (2013) Non-indigenous amphidromous sculpin Cottus pollux small-egg type (Teleostei: Cottidae) detected in rivers entering the Sea of Japan off Honshu Island, Japan. Ichthyol. Res., 60:93-97. GEDIMAPR537
多様度指数A:2, ne:1.99, h:0.5263, SE_h:0.0400, pi:0.001360, SE_pi:0.024554

M7 = [ GEDIMAPH2333, DDBJAB605402 ] ; M8 = [ GEDIMAPH2334, DDBJAB605403 ]
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GEDIMAP IDP1716 (個体群)
個体群名C_reinii_Ishikawa_DS
魚種カジカ(回遊型) Cottus reinii (カジカ科) fish base BOLD
場所石川県 (大聖寺川水系)
解析領域CR (386 bp)
環境情報河川下流
移植状況移植個体群である可能性が高い(国内移入)
出典Tsukagoshi, H., K. Sakai, K. Yamamoto and A. Goto (2013) Non-indigenous amphidromous sculpin Cottus pollux small-egg type (Teleostei: Cottidae) detected in rivers entering the Sea of Japan off Honshu Island, Japan. Ichthyol. Res., 60:93-97. GEDIMAPR537
多様度指数A:3, ne:2.78, h:0.8000, SE_h:0.1640, pi:0.005699, SE_pi:0.000000

S1 = [ GEDIMAPH2879, DDBJAB668993 ] ; S5 = [ GEDIMAPH2882, DDBJAB668996 ] ; S8 = [ GEDIMAPH2880, DDBJAB668994 ]
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GEDIMAP IDP1713 (個体群)
個体群名C_reinii_Ishikawa_Sai_SI
魚種カジカ(回遊型) Cottus reinii (カジカ科) fish base BOLD
場所石川県 (犀川水系)
解析領域CR (386 bp)
環境情報河川下流
移植状況移植個体群である可能性が高い(国内移入)
出典Tsukagoshi, H., K. Sakai, K. Yamamoto and A. Goto (2013) Non-indigenous amphidromous sculpin Cottus pollux small-egg type (Teleostei: Cottidae) detected in rivers entering the Sea of Japan off Honshu Island, Japan. Ichthyol. Res., 60:93-97. GEDIMAPR537
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.005181, SE_pi:0.000000

S1 = [ GEDIMAPH2879, DDBJAB668993 ] ; S3 = [ GEDIMAPH2881, DDBJAB668995 ]
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GEDIMAP IDP1496 (個体群)
個体群名O_masou_masou_Toyama_Jinzu_JIN
魚種ヤマメ・サクラマス・イワメ Oncorhynchus masou masou (サケ科) fish base BOLD
場所富山県 富山県 富山市 (神通川水系)
解析領域ND5 (561 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Yu, J.-N., N. Azuma, M. Yoon, V. Brykov, S. Urawa, M. Nagata, D.-H. Jin and S. Abe (2010) Population genetic structure and phylogeography of masu salmon (Oncorhynchus masou masou) inferred from mitochondrial and microsatellite DNA analyses. Zool. Sci., 27: 375-385 GEDIMAPR481
多様度指数A:5, ne:1.39, h:0.2837, SE_h:0.0702, pi:0.000628, SE_pi:0.013981

H1 = [ GEDIMAPH2446, DDBJAB252719 ] ; H18 = [ GEDIMAPH2462, DDBJAB469794 ] ; H22 = [ GEDIMAPH2466, DDBJAB469798 ] ; H3 = [ GEDIMAPH2447, DDBJAB262721 ] ; H4 = [ GEDIMAPH2448, DDBJAB262722 ]
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GEDIMAP IDP1436 (個体群)
個体群名C_pollux_ME_8
魚種カジカ類 Cottus sp. (カジカ科) fish base BOLD
場所石川県 (犀川水系)
解析領域CR (387 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Tsukagoshi, H., R. Yokoyama and A. Goto (2011) Mitochondrial DNA analysis reveals a unique population structure of the amphidromous sculpin Cottus pollux middle-egg type (Teleostei: Cottidae). Mol. Phylogenet. Evol., 60: 265-270. GEDIMAPR486
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.010336, SE_pi:0.000000

M1 = [ GEDIMAPH2328, DDBJAB605397 ] ; M47 = [ GEDIMAPH2352, DDBJAB605422 ]
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GEDIMAP IDP1435 (個体群)
個体群名C_pollux_ME_7
魚種カジカ類 Cottus sp. (カジカ科) fish base BOLD
場所富山県 (庄川水系)
解析領域CR (387 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Tsukagoshi, H., R. Yokoyama and A. Goto (2011) Mitochondrial DNA analysis reveals a unique population structure of the amphidromous sculpin Cottus pollux middle-egg type (Teleostei: Cottidae). Mol. Phylogenet. Evol., 60: 265-270. GEDIMAPR486
多様度指数A:3, ne:2.78, h:0.8000, SE_h:0.1640, pi:0.002584, SE_pi:0.000000

M1 = [ GEDIMAPH2328, DDBJAB605397 ] ; M16 = [ GEDIMAPH2339, DDBJAB605408 ] ; M2 = [ GEDIMAPH2329, DDBJAB605398 ]
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GEDIMAP IDP780 (個体群)
個体群名O_keta_Toyama
魚種サケ Oncorhynchus keta (サケ科) fish base BOLD
場所富山県 (神通川水系)
解析領域CR (481 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Sato, S., H. Kojima, J. Ando, H. Ando, R. L. Wilmot, L, W. Seeb, V. Efremov, L. LeClair, W. Buchholz, D.-H. Jin, S. Urawa, M. Kaeriyama, A. Urano and S. Abe (2004) Genetic population structure of chum salmon in the Pacific Rim inferred from mitochondrial DNA sequence variation. Environ. Biol. Fish. 69: 37-50 GEDIMAPR211
多様度指数A:3, ne:1.63, h:0.3946, SE_h:0.0722, pi:0.001188, SE_pi:0.019619

A_1 = [ GEDIMAPH1188, DDBJAB039890 ] ; B_3 = [ GEDIMAPH1194 ] ; C_1 = [ GEDIMAPH1196, DDBJAB039898 ]
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GEDIMAP IDP612 (個体群)
個体群名M_dolomieu_Toyama_Sakaigawa
魚種コクチバス Micropterus dolomieu (サンフィッシュ科) fish base BOLD
場所富山県 (庄川水系)
解析領域CR (294 bp)
環境情報ダム湖
移植状況外来種である(国外移入)
出典佐藤千夏・向井貴彦・淀太我・佐久間徹・中井克樹 (2007) 日本国内におけるコクチバスのmtDNAハプロタイプの分布. 魚類学雑誌, 54(2): 225-230 GEDIMAPR285
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

n = [ GEDIMAPH875, DDBJAB190251 ]
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GEDIMAP IDP585 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_pluvius_Fukui_Kuzuryu_PU-10
魚種ニッコウイワナ Salvelinus leucomaenis pluvius (サケ科) fish base BOLD
場所福井県 (九頭竜川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Yamamoto, S., K. Morita, S. Kitano, K. Watanabe, I. Koizumi, K. Maekawa and K. Takamura (2004) Phylogeography of white-spotted charr (Salvelinus leucomaenis) inferred from mitochondrial DNA sequences. Zool. Sci. 21: 229-240 GEDIMAPR213
多様度指数A:2, ne:1.80, h:0.6667, SE_h:0.3143, pi:0.004788, SE_pi:0.000000

Hap16 = [ GEDIMAPH567 ] ; Hap17 = [ GEDIMAPH568 ]
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GEDIMAP IDP584 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_pluvius_Toyama_Arimine_PU-9
魚種ニッコウイワナ Salvelinus leucomaenis pluvius (サケ科) fish base BOLD
場所富山県 (常願寺川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報ダム湖
移植状況自然分布
出典Yamamoto, S., K. Morita, S. Kitano, K. Watanabe, I. Koizumi, K. Maekawa and K. Takamura (2004) Phylogeography of white-spotted charr (Salvelinus leucomaenis) inferred from mitochondrial DNA sequences. Zool. Sci. 21: 229-240 GEDIMAPR213
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap1 = [ GEDIMAPH552, DDBJAB111031 ]
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GEDIMAP IDP583 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_pluvius_Toyama_Korobe_PU-8
魚種ニッコウイワナ Salvelinus leucomaenis pluvius (サケ科) fish base BOLD
場所富山県 (黒部川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Yamamoto, S., K. Morita, S. Kitano, K. Watanabe, I. Koizumi, K. Maekawa and K. Takamura (2004) Phylogeography of white-spotted charr (Salvelinus leucomaenis) inferred from mitochondrial DNA sequences. Zool. Sci. 21: 229-240 GEDIMAPR213
多様度指数A:2, ne:1.80, h:0.6667, SE_h:0.3143, pi:0.005984, SE_pi:0.000000

Hap1 = [ GEDIMAPH552, DDBJAB111031 ] ; Hap14 = [ GEDIMAPH565 ]
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GEDIMAP IDP283 (個体群)
個体群名O_masou_masou_Toyama
魚種ヤマメ・サクラマス・イワメ Oncorhynchus masou masou (サケ科) fish base BOLD
場所富山県 (神通川水系)
解析領域ATPase_6, COIII, tRNA_G, ND3, tRNA_R, ND4L (2166 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Oohara, I., K. Sawano and T. Okazaki (1997) Mitochondrial DNA sequence analysis of the masu salmon -- phylogeny in the genus Oncorhynchus. Mol. Phyl. Evol., 7(1): 71-78. GEDIMAPR101
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

masusalmon = [ GEDIMAPH441, DDBJD63336 ]
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GEDIMAP IDP238 (個体群)
個体群名G_sp__Toyama_Shinminato
魚種シンジコハゼ Gymnogobius taranetzi (ハゼ科) fish base BOLD
場所富山県 射水市 (旧新湊市) (庄川水系)
解析領域cyt_b (705 bp)
環境情報河川下流
移植状況自然分布
出典Sota, T., T. Mukai, T. Shinozaki, H. Sato and K. Yodoe (2005) Genetic differentiation of the gobies Gymnogobius castaneus and G. taranetzi in the region surrounding the Sea of Japan as inferred from a mitochondrial gene genealogy. Zool. Sci., 22: 87-93 GEDIMAPR242
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

AY450385 = [ GEDIMAPH405, DDBJAY450385 ]
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GEDIMAP IDP188 (個体群)
個体群名N_delicata_Toyama_Hino
魚種アジメドジョウ Niwaella delicata (ドジョウ科) fish base BOLD
場所富山県 (九頭竜川水系)
解析領域cyt_b (725 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Kitagawa, T., M. Watanabe, T. Kobayashi, M. Yoshioka, M. Kashiwagi and T. Okazaki (2001) Two genetically divergent groups in the Japanese spined loach, Cobitis takatsuensis, and their phylogenetic relationships among Japanese Cobitis inferred from mitochondrial DNA analyses. Zool. Sci., 18: 249-259 GEDIMAPR157
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Niwaellade = [ GEDIMAPH373, DDBJAB039352 ]
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GEDIMAP IDP158 (個体群)
個体群名L_echigonia_Kanazu
魚種ホトケドジョウ Lefua echigonia (タニノボリ科) fish base BOLD
場所福井県 あわら市 (旧金津町) (九頭竜川水系)
解析領域cyt_b (1026 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Saka R., Y. Takehana, N. Suguro and M. Sakaizumi (2003) Genetic population structure of Lefua echigonia inferred from allozymic and mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res., 50: 140-148 GEDIMAPR195
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

mt17 = [ GEDIMAPH335, DDBJAB080176 ]

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