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GEDIMAP IDP2169 (個体群)
個体群名S_asotus_Shimane_Ohta
魚種ナマズ Silurus asotus (ナマズ科) fish base BOLD
場所島根県 (江の川水系)
解析領域CR (410 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Saso_18 = [ GEDIMAPH3726, DDBJLC097705 ]
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GEDIMAP IDP1975 (個体群)
個体群名R_sp__BW_Shimane_Yatogawa
魚種ビワヨシノボリ Rhinogobius sp. BW (ハゼ科) fish base BOLD
場所島根県 江津市 (江の川水系)
解析領域ND5 (945 bp)
環境情報河川上流
移植状況明らかに移植個体群である(国内移入)
出典 未発表データ: GEDIMAPR580
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

BW15 = [ GEDIMAPH3317, DDBJLC085154 ]
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GEDIMAP IDP1915 (個体群)
個体群名O_platypus_Shimane_Takatsugawa
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所島根県 (高津川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況移植個体群である可能性が高い(国内移入)
出典 未発表データ: GEDIMAPR577
多様度指数A:5, ne:4.50, h:0.9333, SE_h:0.1217, pi:0.005378, SE_pi:0.000000

WJ02 = [ GEDIMAPH3111, DDBJLC019794 ] ; WJ03 = [ GEDIMAPH3112, DDBJLC019795 ] ; WJ08 = [ GEDIMAPH3117, DDBJLC019800 ] ; WJ20 = [ GEDIMAPH3129, DDBJLC019812 ] ; WJ62 = [ GEDIMAPH3171, DDBJLC019854 ]
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GEDIMAP IDP1914 (個体群)
個体群名O_platypus_Shimane_HiikawaChannel
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所島根県 (斐伊川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況移植個体群である可能性が高い(国内移入)
出典 未発表データ: GEDIMAPR577
多様度指数A:5, ne:5.00, h:1.0000, SE_h:0.1265, pi:0.008765, SE_pi:0.000000

WJ10 = [ GEDIMAPH3119, DDBJLC019802 ] ; WJ34 = [ GEDIMAPH3143, DDBJLC019826 ] ; WJ55 = [ GEDIMAPH3164, DDBJLC019847 ] ; WJ84 = [ GEDIMAPH3193, DDBJLC019876 ] ; WJ86 = [ GEDIMAPH3195, DDBJLC019878 ]
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GEDIMAP IDP1913 (個体群)
個体群名O_platypus_Shimane_Hiikawa
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所島根県 (斐伊川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況移植個体群である可能性が高い(国内移入)
出典 未発表データ: GEDIMAPR577
多様度指数A:10, ne:7.54, h:0.9341, SE_h:0.0508, pi:0.007322, SE_pi:0.063658

WJ16 = [ GEDIMAPH3125, DDBJLC019808 ] ; WJ18 = [ GEDIMAPH3127, DDBJLC019810 ] ; WJ24 = [ GEDIMAPH3133, DDBJLC019816 ] ; WJ30 = [ GEDIMAPH3139, DDBJLC019822 ] ; WJ34 = [ GEDIMAPH3143, DDBJLC019826 ] ; WJ36 = [ GEDIMAPH3145, DDBJLC019828 ] ; WJ48 = [ GEDIMAPH3157, DDBJLC019840 ] ; WJ54 = [ GEDIMAPH3163, DDBJLC019846 ] ; WJ60 = [ GEDIMAPH3169, DDBJLC019852 ] ; WJ85 = [ GEDIMAPH3194, DDBJLC019877 ]
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GEDIMAP IDP1829 (個体群)
個体群名L_reini_Shimane_Gonokawa_32
魚種アカザ Liobagrus reini (アカザ科) fish base BOLD
場所島根県 (江の川水系)
解析領域cyt_b (580 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Nakagawa, N., S. Seki, T. Ishikawa and K. Watanabe (2015) Genetic population structure of the Japanese torrent catfish Liobagrus reinii (Amblycipitidae) inferred from mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res. GEDIMAPR568
多様度指数A:3, ne:2.27, h:0.6222, SE_h:0.1383, pi:0.042912, SE_pi:0.191861

H02 = [ GEDIMAPH3057, DDBJLC064931,LC064932 ] ; H38 = [ GEDIMAPH3093, DDBJLC064950 ] ; H39 = [ GEDIMAPH3094, DDBJLC064985 ]
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GEDIMAP IDP1828 (個体群)
個体群名L_reini_Tottori_Hino_31
魚種アカザ Liobagrus reini (アカザ科) fish base BOLD
場所鳥取県 伯耆町 (日野川(鳥取県)水系)
解析領域cyt_b (580 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Nakagawa, N., S. Seki, T. Ishikawa and K. Watanabe (2015) Genetic population structure of the Japanese torrent catfish Liobagrus reinii (Amblycipitidae) inferred from mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res. GEDIMAPR568
多様度指数A:4, ne:1.94, h:0.5256, SE_h:0.1527, pi:0.001857, SE_pi:0.033145

H42 = [ GEDIMAPH3097, DDBJLC064952 ] ; H43 = [ GEDIMAPH3098, DDBJLC064953 ] ; H45 = [ GEDIMAPH3100, DDBJLC064954 ] ; H46 = [ GEDIMAPH3101, DDBJLC064955 ]
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GEDIMAP IDP1827 (個体群)
個体群名L_reini_Tottori_Tenjin_30
魚種アカザ Liobagrus reini (アカザ科) fish base BOLD
場所鳥取県 三朝町 (天神川水系)
解析領域cyt_b (580 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Nakagawa, N., S. Seki, T. Ishikawa and K. Watanabe (2015) Genetic population structure of the Japanese torrent catfish Liobagrus reinii (Amblycipitidae) inferred from mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res. GEDIMAPR568
多様度指数A:2, ne:1.69, h:0.4762, SE_h:0.1713, pi:0.000821, SE_pi:0.045728

H45 = [ GEDIMAPH3100, DDBJLC064954 ] ; H48 = [ GEDIMAPH3103, DDBJLC064957 ]
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GEDIMAP IDP1703 (個体群)
個体群名S_variegatus_variegatus_Shimane_Hii
魚種カワヒガイ Sarcocheilichthys variegatus variegatus (コイ科) fish base BOLD
場所島根県 雲南市 (斐伊川水系)
解析領域cyt_b (620 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Komiya, T., S. Fujita-Yanagibayashi and K. Watanabe (2013) Multiple colonizations of Lake Biwa by Sarcocheilichthys fishes and their population history. Environ. Biol. Fish. DOI 10.1007/s10641-013-0176-9 GEDIMAPR539
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

B006 = [ GEDIMAPH2863, DDBJAB780986 ]
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GEDIMAP IDP1439 (個体群)
個体群名C_pollux_ME_10
魚種カジカ類 Cottus sp. (カジカ科) fish base BOLD
場所島根県 (江の川水系)
解析領域CR (387 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Tsukagoshi, H., R. Yokoyama and A. Goto (2011) Mitochondrial DNA analysis reveals a unique population structure of the amphidromous sculpin Cottus pollux middle-egg type (Teleostei: Cottidae). Mol. Phylogenet. Evol., 60: 265-270. GEDIMAPR486
多様度指数A:7, ne:4.00, h:0.7826, SE_h:0.0544, pi:0.004803, SE_pi:0.043640

M40 = [ GEDIMAPH2346, DDBJAB605416 ] ; M41 = [ GEDIMAPH2347, DDBJAB605417 ] ; M42 = [ GEDIMAPH2355, DDBJAB605425 ] ; M43 = [ GEDIMAPH2354, DDBJAB605424 ] ; M44 = [ GEDIMAPH2357, DDBJAB605427 ] ; M7 = [ GEDIMAPH2333, DDBJAB605402 ] ; M9 = [ GEDIMAPH2335, DDBJAB605404 ]
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GEDIMAP IDP1077 (個体群)
個体群名L_sp__Tottori_Minari_1
魚種ナガレホトケドジョウ Lefua sp. (タニノボリ科) fish base BOLD
場所鳥取県 用瀬 (千代川水系)
解析領域CR (910 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Kobayashi, T. (2008) Genetic characteristics of local populations of the fluvial eight-barbel loach Lefua sp., in Tottori and Okayama Prefectures. Natural Environmental Science Research (Hiraoka Environmental Science Laboratory), 21: 37-42. GEDIMAPR392
多様度指数A:3, ne:2.57, h:0.7333, SE_h:0.1552, pi:0.001832, SE_pi:0.000000

Lsp01 = [ GEDIMAPH1658, DDBJAB468988 ] ; Lsp02 = [ GEDIMAPH1659, DDBJAB468989 ] ; Lsp03 = [ GEDIMAPH1660, DDBJAB468991 ]
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GEDIMAP IDP697 (個体群)
個体群名M_salmoides_Shimane_Hamahara_39_Sm-1
魚種オオクチバス Micropterus salmoides (サンフィッシュ科) fish base BOLD
場所島根県 (江の川水系)
解析領域CR (294 bp)
環境情報ダム湖
移植状況外来種である(国外移入)
出典高村健二 (2005) 日本産ブラックバスにおけるミトコンドリアDNAハプロタイプの分布. 魚類学雑誌,52:107−114 GEDIMAPR235
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

h_AB190245 = [ GEDIMAPH1060, DDBJAB190245 ]
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GEDIMAP IDP596 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_imbrius_Shimane_Takatsu_IM-3
魚種ゴギ Salvelinus leucomaenis imbrius (サケ科) fish base BOLD
場所島根県 (高津川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Yamamoto, S., K. Morita, S. Kitano, K. Watanabe, I. Koizumi, K. Maekawa and K. Takamura (2004) Phylogeography of white-spotted charr (Salvelinus leucomaenis) inferred from mitochondrial DNA sequences. Zool. Sci. 21: 229-240 GEDIMAPR213
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap21 = [ GEDIMAPH572 ]
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GEDIMAP IDP594 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_imbrius_Shimane_Hii_IM-1
魚種ゴギ Salvelinus leucomaenis imbrius (サケ科) fish base BOLD
場所島根県 (斐伊川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Yamamoto, S., K. Morita, S. Kitano, K. Watanabe, I. Koizumi, K. Maekawa and K. Takamura (2004) Phylogeography of white-spotted charr (Salvelinus leucomaenis) inferred from mitochondrial DNA sequences. Zool. Sci. 21: 229-240 GEDIMAPR213
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap20 = [ GEDIMAPH571 ]
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GEDIMAP IDP587 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_pluvius_Tottori_Tenjin_PU-12
魚種ニッコウイワナ Salvelinus leucomaenis pluvius (サケ科) fish base BOLD
場所鳥取県 (天神川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Yamamoto, S., K. Morita, S. Kitano, K. Watanabe, I. Koizumi, K. Maekawa and K. Takamura (2004) Phylogeography of white-spotted charr (Salvelinus leucomaenis) inferred from mitochondrial DNA sequences. Zool. Sci. 21: 229-240 GEDIMAPR213
多様度指数A:2, ne:1.80, h:0.6667, SE_h:0.3143, pi:0.005984, SE_pi:0.000000

Hap1 = [ GEDIMAPH552, DDBJAB111031 ] ; Hap17 = [ GEDIMAPH568 ]
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GEDIMAP IDP438 (個体群)
個体群名O_hikimiensis_takatsu
魚種イシドンコ Odontobutis hikimiensis (ドンコ科) fish base BOLD
場所島根県 (高津川水系)
解析領域12S_rRNA, 16S_rRNA (1244 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典向井貴彦・西田 睦 (2003) 日本産ドンコにおけるミトコンドリアDNAの系統と関東地方への人為移植の分子的証拠. 魚類学雑誌,50:71-76 GEDIMAPR203
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Odont_hiki = [ GEDIMAPH719, DDBJAB095519,AB095520 ]
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GEDIMAP IDP239 (個体群)
個体群名G_castaneus_Shimane_Nakaumi
魚種ビリンゴ Gymnogobius breunigii (ハゼ科) fish base BOLD
場所島根県 (斐伊川水系)
解析領域cyt_b (705 bp)
環境情報自然湖(大規模)
移植状況自然分布
出典Sota, T., T. Mukai, T. Shinozaki, H. Sato and K. Yodoe (2005) Genetic differentiation of the gobies Gymnogobius castaneus and G. taranetzi in the region surrounding the Sea of Japan as inferred from a mitochondrial gene genealogy. Zool. Sci., 22: 87-93 GEDIMAPR242
多様度指数A:3, ne:3.00, h:1.0000, SE_h:0.2722, pi:0.005674, SE_pi:0.000000

AY450368 = [ GEDIMAPH391, DDBJAY450368 ] ; AY450369 = [ GEDIMAPH392, DDBJAY450369 ] ; AY450370 = [ GEDIMAPH393, DDBJAY450370 ]
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GEDIMAP IDP177 (個体群)
個体群名T_sp__Shimane
魚種シマハゼ類 Tridentiger sp. (ハゼ科) fish base BOLD
場所島根県 (斐伊川水系)
解析領域cyt_b (1282 bp)
環境情報自然湖(大規模)
移植状況自然分布
出典Akihito, A. Iwata, T. Kobayashi, K. Ikeo, T. Imanishi, H. Ono, Y. Umehara, C. Hamamatsu, K. Sugiyama, Y. Ikeda, K. Sakamoto, A. Fumihito, S. Ohno, and T. Gojobori (2000) Evolutionary aspects of gobioid fishes based upon a phylogenetic analysis of mitochondrial cytochrome b genes. Gene, 259: 5-15 GEDIMAPR145
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Tb = [ GEDIMAPH355, DDBJAB021254 ]
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GEDIMAP IDP41 (個体群)
個体群名P_nudiceps_Hiroshima_Saijo_41
魚種ギギ Pseudobagrus nudiceps (ギギ科) fish base BOLD
場所広島県 庄原 (江の川水系)
解析領域CR (414 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Watanabe, K. and M. Nishida (2003) Genetic population structure of Japanese bagrid catfishes. Ichthyol. Res., 50: 301-309 GEDIMAPR197
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

I = [ GEDIMAPH66 ]

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