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GEDIMAP IDP2234 (個体群)
個体群名T_hakonensis_21_Tama
魚種ウグイ Tribolodon hakonensis (コイ科) fish base BOLD
場所東京都 (多摩川水系)
解析領域cyt_b (758 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., H. Sakai, T. Sanada and M. Nishida (2018) Comparative phylogeography of diadromous and freshwater daces of the genus Tribolodon (Cyprinidae). Ichthyol Res., 65 GEDIMAPR603
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

h54 = [ GEDIMAPH3912, DDBJLC277482 ]
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GEDIMAP IDP2211 (個体群)
個体群名T_brandtii_22_Tokyo_Bay
魚種マルタ Tribolodon brandtii (コイ科) fish base BOLD
場所東京都 (その他水系)
解析領域cyt_b (758 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., H. Sakai, T. Sanada and M. Nishida (2018) Comparative phylogeography of diadromous and freshwater daces of the genus Tribolodon (Cyprinidae). Ichthyol Res., 65 GEDIMAPR603
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

bm01 = [ GEDIMAPH3836, DDBJLC277336 ]
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GEDIMAP IDP2210 (個体群)
個体群名T_brandtii_21_Tama
魚種マルタ Tribolodon brandtii (コイ科) fish base BOLD
場所東京都 (多摩川水系)
解析領域cyt_b (758 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., H. Sakai, T. Sanada and M. Nishida (2018) Comparative phylogeography of diadromous and freshwater daces of the genus Tribolodon (Cyprinidae). Ichthyol Res., 65 GEDIMAPR603
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

bm01 = [ GEDIMAPH3836, DDBJLC277336 ]
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GEDIMAP IDP2036 (個体群)
個体群名C_sp__Tokyo_Chofu
魚種フナ類 Carassius sp. (コイ科) fish base BOLD
場所東京都 調布市 (多摩川水系)
解析領域cyt_b (690 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:4, ne:3.27, h:0.8095, SE_h:0.1298, pi:0.017529, SE_pi:0.212531

cb24 = [ GEDIMAPH3822, DDBJLC097474 ] ; cb27 = [ GEDIMAPH3506, DDBJLC097477 ] ; cb28 = [ GEDIMAPH3507, DDBJLC097478 ] ; cb9 = [ GEDIMAPH2891, DDBJAB852592 ]
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GEDIMAP IDP1852 (個体群)
個体群名O_platypus_Tokyo_Tama
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所東京都 (多摩川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR573
多様度指数A:4, ne:1.64, h:0.4231, SE_h:0.1645, pi:0.005414, SE_pi:0.056666

EJ13 = [ GEDIMAPH3233, DDBJLC019917 ] ; EJ16 = [ GEDIMAPH3236, DDBJLC019920 ] ; WJ44 = [ GEDIMAPH3153, DDBJLC019836 ] ; WJ63 = [ GEDIMAPH3172, DDBJLC019855 ]
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GEDIMAP IDP1851 (個体群)
個体群名O_platypus_Tokyo_Aki
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所東京都 (多摩川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR573
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.014940, SE_pi:0.000000

EJ13 = [ GEDIMAPH3233, DDBJLC019917 ] ; WJ72 = [ GEDIMAPH3181, DDBJLC019864 ]
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GEDIMAP IDP1806 (個体群)
個体群名L_reini_Tokyo_Tama_11
魚種アカザ Liobagrus reini (アカザ科) fish base BOLD
場所東京都 あきる野市 (多摩川水系)
解析領域cyt_b (580 bp)
環境情報河川中流
移植状況移植個体群である可能性が高い(国内移入)
出典Nakagawa, N., S. Seki, T. Ishikawa and K. Watanabe (2015) Genetic population structure of the Japanese torrent catfish Liobagrus reinii (Amblycipitidae) inferred from mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res. GEDIMAPR568
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

H14 = [ GEDIMAPH3069, DDBJLC064939,LC064940,LC064941 ]
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GEDIMAP IDP945 (個体群)
個体群名O_latipes_Tokyo_Setagayaku
魚種メダカ Oryzias latipes (メダカ科) fish base BOLD
場所東京都 世田谷区 (多摩川水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Takehana, Y., N. Nagai, M. Matsuda, K. Tsuchiya, and M. Sakaizumi (2003) Geographic variation and diversity of the cytochrome b gene in Japanese wild populations of medaka, Oryzias latipes. Zool. Sci., 20: 1279-1291 GEDIMAPR199
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

B36_Setaga = [ GEDIMAPH1503, DDBJAB084741 ]
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GEDIMAP IDP944 (個体群)
個体群名O_latipes_Tokyo_Kitaku
魚種メダカ Oryzias latipes (メダカ科) fish base BOLD
場所東京都 北区 (利根川水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Takehana, Y., N. Nagai, M. Matsuda, K. Tsuchiya, and M. Sakaizumi (2003) Geographic variation and diversity of the cytochrome b gene in Japanese wild populations of medaka, Oryzias latipes. Zool. Sci., 20: 1279-1291 GEDIMAPR199
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

B15_Kitaku = [ GEDIMAPH1479, DDBJAB084716 ]
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GEDIMAP IDP579 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_pluvius_Tokyo_Ara_PU-4
魚種ニッコウイワナ Salvelinus leucomaenis pluvius (サケ科) fish base BOLD
場所東京都 (荒川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Yamamoto, S., K. Morita, S. Kitano, K. Watanabe, I. Koizumi, K. Maekawa and K. Takamura (2004) Phylogeography of white-spotted charr (Salvelinus leucomaenis) inferred from mitochondrial DNA sequences. Zool. Sci. 21: 229-240 GEDIMAPR213
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap22 = [ GEDIMAPH573 ]
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GEDIMAP IDP305 (個体群)
個体群名R_sp__OR_Tokyo
魚種トウヨシノボリ(橙色型) Rhinogobius sp. OR (ハゼ科) fish base BOLD
場所東京都 (多摩川水系)
解析領域ND5 (945 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Mukai, T., S. Nakamura, T. Suzuki and M. Nishida (2005) Mitochondrial DNA divergence in yoshinobori gobies (Rhinogobius species complex) between the Bonin Islands and the Japan-Ryukyu Archipelago. Ichthyol. Res., 52: 410-413 GEDIMAPR239
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

RspORTokyo = [ GEDIMAPH467, DDBJAB190333 ]
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GEDIMAP IDP296 (個体群)
個体群名R_sp_BI_Tokyo_Ogasawara
魚種ヨシノボリ類 Rhinogobius spp. (ハゼ科) fish base BOLD
場所東京都 小笠原諸島 父島および母島の計5地点 (その他水系)
解析領域ND5 (945 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Mukai, T., S. Nakamura, T. Suzuki and M. Nishida (2005) Mitochondrial DNA divergence in yoshinobori gobies (Rhinogobius species complex) between the Bonin Islands and the Japan-Ryukyu Archipelago. Ichthyol. Res., 52: 410-413 GEDIMAPR239
多様度指数A:4, ne:2.25, h:0.5917, SE_h:0.1217, pi:0.001711, SE_pi:0.029104

RspBI1 = [ GEDIMAPH455, DDBJAB190321 ] ; RspBI2 = [ GEDIMAPH456, DDBJAB190322 ] ; RspBI3 = [ GEDIMAPH457, DDBJAB190323 ] ; RspBI4 = [ GEDIMAPH458, DDBJAB190324 ]
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GEDIMAP IDP269 (個体群)
個体群名L_echigonia_Tokyo_Asakawa
魚種ホトケドジョウ Lefua echigonia (タニノボリ科) fish base BOLD
場所東京都 (多摩川水系)
解析領域CR (915 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Sakai, T., M. Mihara, H. Shitara, H. Yonekawa, K. Hosoya and J. Miyazaki (2003) Phylogenetic relationships and intraspecific variations of loaches of the genus Lefua (Balitoridae, Cypriniformes). Zool. Sci., 20: 501-514 GEDIMAPR196
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Asakawa = [ GEDIMAPH308, DDBJAB102837 ]
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GEDIMAP IDP234 (個体群)
個体群名G_laevis_Tokyo_Akigawa
魚種ジュズカケハゼ Gymnogobius castaneus (ハゼ科) fish base BOLD
場所東京都 (多摩川水系)
解析領域cyt_b (705 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Sota, T., T. Mukai, T. Shinozaki, H. Sato and K. Yodoe (2005) Genetic differentiation of the gobies Gymnogobius castaneus and G. taranetzi in the region surrounding the Sea of Japan as inferred from a mitochondrial gene genealogy. Zool. Sci., 22: 87-93 GEDIMAPR242
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

AY450384 = [ GEDIMAPH404, DDBJAY450384 ]
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GEDIMAP IDP145 (個体群)
個体群名L_echigonia_Machida
魚種ホトケドジョウ Lefua echigonia (タニノボリ科) fish base BOLD
場所東京都 町田市 (鶴見川水系)
解析領域cyt_b (1026 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Saka R., Y. Takehana, N. Suguro and M. Sakaizumi (2003) Genetic population structure of Lefua echigonia inferred from allozymic and mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res., 50: 140-148 GEDIMAPR195
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.033138, SE_pi:0.000000

mt10 = [ GEDIMAPH331, DDBJAB080170 ] ; mt8 = [ GEDIMAPH329, DDBJAB080159 ]
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GEDIMAP IDP144 (個体群)
個体群名L_echigonia_Hachioji
魚種ホトケドジョウ Lefua echigonia (タニノボリ科) fish base BOLD
場所東京都 八王子市 (多摩川水系)
解析領域cyt_b (1026 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Saka R., Y. Takehana, N. Suguro and M. Sakaizumi (2003) Genetic population structure of Lefua echigonia inferred from allozymic and mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res., 50: 140-148 GEDIMAPR195
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

mt8 = [ GEDIMAPH329, DDBJAB080159 ]
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GEDIMAP IDP143 (個体群)
個体群名L_echigonia_Akiruno
魚種ホトケドジョウ Lefua echigonia (タニノボリ科) fish base BOLD
場所東京都 あきる野市 (多摩川水系)
解析領域cyt_b (1026 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Saka R., Y. Takehana, N. Suguro and M. Sakaizumi (2003) Genetic population structure of Lefua echigonia inferred from allozymic and mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res., 50: 140-148 GEDIMAPR195
多様度指数A:2, ne:1.20, h:0.1818, SE_h:0.1436, pi:0.006025, SE_pi:0.066000

mt10 = [ GEDIMAPH331, DDBJAB080170 ] ; mt8 = [ GEDIMAPH329, DDBJAB080159 ]
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GEDIMAP IDP142 (個体群)
個体群名L_echigonia_OmeB
魚種ホトケドジョウ Lefua echigonia (タニノボリ科) fish base BOLD
場所東京都 青梅市 (多摩川水系)
解析領域cyt_b (1026 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Saka R., Y. Takehana, N. Suguro and M. Sakaizumi (2003) Genetic population structure of Lefua echigonia inferred from allozymic and mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res., 50: 140-148 GEDIMAPR195
多様度指数A:2, ne:1.35, h:0.2821, SE_h:0.1417, pi:0.001924, SE_pi:0.033743

mt8 = [ GEDIMAPH329, DDBJAB080159 ] ; mt9 = [ GEDIMAPH330, DDBJAB080163 ]
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GEDIMAP IDP141 (個体群)
個体群名L_echigonia_OmeA
魚種ホトケドジョウ Lefua echigonia (タニノボリ科) fish base BOLD
場所東京都 青梅市 (多摩川水系)
解析領域cyt_b (1026 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Saka R., Y. Takehana, N. Suguro and M. Sakaizumi (2003) Genetic population structure of Lefua echigonia inferred from allozymic and mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res., 50: 140-148 GEDIMAPR195
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

mt9 = [ GEDIMAPH330, DDBJAB080163 ]
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GEDIMAP IDP120 (個体群)
個体群名Z_platypus_Ara
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所東京都 (荒川水系)
解析領域CR (496 bp)
環境情報河川中流
移植状況明らかに移植個体群である(国内移入)
出典Ma, G.-C., K. Watanabe, H.-S. Tsao and H.-T. Yu (2006) Mitochondrial phylogeny reveals the artificial introduction of the pale chub Zacco platypus (Cyprinidae) in Taiwan. Ichthyol. Res., 53: 323-329 GEDIMAPR278
多様度指数A:6, ne:4.57, h:0.8929, SE_h:0.1113, pi:0.013969, SE_pi:0.140651

J18 = [ GEDIMAPH219, DDBJDQ377736 ] ; J19 = [ GEDIMAPH220, DDBJDQ377737 ] ; J20 = [ GEDIMAPH221, DDBJDQ377738 ] ; J21 = [ GEDIMAPH222, DDBJDQ377739 ] ; J22 = [ GEDIMAPH223, DDBJDQ377740 ] ; J3 = [ GEDIMAPH204, DDBJDQ377721 ]

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