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GEDIMAP IDP2230 (個体群)
個体群名T_hakonensis_15_Chikuma
魚種ウグイ Tribolodon hakonensis (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 (信濃川水系)
解析領域cyt_b (758 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., H. Sakai, T. Sanada and M. Nishida (2018) Comparative phylogeography of diadromous and freshwater daces of the genus Tribolodon (Cyprinidae). Ichthyol Res., 65 GEDIMAPR603
多様度指数A:7, ne:5.14, h:0.8788, SE_h:0.0751, pi:0.004238, SE_pi:0.052341

h37 = [ GEDIMAPH3895, DDBJLC277411 ] ; h39 = [ GEDIMAPH3897, DDBJLC277446 ] ; h42 = [ GEDIMAPH3900, DDBJLC277415 ] ; h44 = [ GEDIMAPH3902, DDBJLC277452 ] ; h45 = [ GEDIMAPH3903, DDBJLC277450 ] ; h60 = [ GEDIMAPH3918, DDBJLC277445 ] ; h62 = [ GEDIMAPH3920, DDBJLC277451 ]
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GEDIMAP IDP2106 (個体群)
個体群名T_hakonensis_Nagano_Chikuma
魚種ウグイ Tribolodon hakonensis (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 小諸市 (信濃川水系)
解析領域cyt_b (710 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Thak_b01 = [ GEDIMAPH3562, DDBJLC097533 ]
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GEDIMAP IDP1868 (個体群)
個体群名O_platypus_Nagano_Tenryu
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 (天竜川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR574
多様度指数A:8, ne:7.36, h:0.9722, SE_h:0.0640, pi:0.006197, SE_pi:0.079783

EJ15 = [ GEDIMAPH3235, DDBJLC019919 ] ; EJ16 = [ GEDIMAPH3236, DDBJLC019920 ] ; EJ18 = [ GEDIMAPH3238, DDBJLC019922 ] ; EJ20 = [ GEDIMAPH3240, DDBJLC019924 ] ; EJ21 = [ GEDIMAPH3241, DDBJLC019925 ] ; EJ22 = [ GEDIMAPH3242, DDBJLC019926 ] ; EJ23 = [ GEDIMAPH3243, DDBJLC019927 ] ; WJ35 = [ GEDIMAPH3144, DDBJLC019827 ]
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GEDIMAP IDP1867 (個体群)
個体群名O_platypus_Nagano_Mibugawa
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 (天竜川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況不明
出典 未発表データ: GEDIMAPR574
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.001992, SE_pi:0.000000

EJ16 = [ GEDIMAPH3236, DDBJLC019920 ] ; EJ21 = [ GEDIMAPH3241, DDBJLC019925 ]
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GEDIMAP IDP1866 (個体群)
個体群名O_platypus_Nagano_ChubeNogu
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 (その他水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況移植個体群である可能性が高い(国内移入)
出典 未発表データ: GEDIMAPR574
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.007968, SE_pi:0.000000

WJ65 = [ GEDIMAPH3174, DDBJLC019857 ] ; WJ82 = [ GEDIMAPH3191, DDBJLC019874 ]
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GEDIMAP IDP1865 (個体群)
個体群名O_platypus_Nagano_Chikuma
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 (信濃川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況移植個体群である可能性が高い(国内移入)
出典 未発表データ: GEDIMAPR574
多様度指数A:13, ne:11.56, h:0.9706, SE_h:0.0278, pi:0.007748, SE_pi:0.060772

EJ13 = [ GEDIMAPH3233, DDBJLC019917 ] ; WJ13 = [ GEDIMAPH3122, DDBJLC019805 ] ; WJ21 = [ GEDIMAPH3130, DDBJLC019813 ] ; WJ24 = [ GEDIMAPH3133, DDBJLC019816 ] ; WJ27 = [ GEDIMAPH3136, DDBJLC019819 ] ; WJ32 = [ GEDIMAPH3141, DDBJLC019824 ] ; WJ35 = [ GEDIMAPH3144, DDBJLC019827 ] ; WJ57 = [ GEDIMAPH3166, DDBJLC019849 ] ; WJ62 = [ GEDIMAPH3171, DDBJLC019854 ] ; WJ66 = [ GEDIMAPH3175, DDBJLC019858 ] ; WJ72 = [ GEDIMAPH3181, DDBJLC019864 ] ; WJ82 = [ GEDIMAPH3191, DDBJLC019874 ] ; WJ87 = [ GEDIMAPH3196, DDBJLC019879 ]
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GEDIMAP IDP1864 (個体群)
個体群名O_platypus_Nagano_Sai
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 (犀川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況移植個体群である可能性が高い(国内移入)
出典 未発表データ: GEDIMAPR574
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

WJ13 = [ GEDIMAPH3122, DDBJLC019805 ]
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GEDIMAP IDP1863 (個体群)
個体群名O_platypus_Nagano_Asa
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 (信濃川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況移植個体群である可能性が高い(国内移入)
出典 未発表データ: GEDIMAPR574
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.015936, SE_pi:0.000000

EJ13 = [ GEDIMAPH3233, DDBJLC019917 ] ; WJ21 = [ GEDIMAPH3130, DDBJLC019813 ]
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GEDIMAP IDP1811 (個体群)
個体群名L_reini_Nagano_Tenryu_15-2
魚種アカザ Liobagrus reini (アカザ科) fish base BOLD
場所長野県 伊那市 (天竜川水系)
解析領域cyt_b (580 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Nakagawa, N., S. Seki, T. Ishikawa and K. Watanabe (2015) Genetic population structure of the Japanese torrent catfish Liobagrus reinii (Amblycipitidae) inferred from mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res. GEDIMAPR568
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

H11 = [ GEDIMAPH3066, DDBJLC064934,LC064935 ]
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GEDIMAP IDP1800 (個体群)
個体群名L_reini_Nagano_Shinano_7
魚種アカザ Liobagrus reini (アカザ科) fish base BOLD
場所長野県 佐久市 (信濃川水系)
解析領域cyt_b (580 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Nakagawa, N., S. Seki, T. Ishikawa and K. Watanabe (2015) Genetic population structure of the Japanese torrent catfish Liobagrus reinii (Amblycipitidae) inferred from mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res. GEDIMAPR568
多様度指数A:5, ne:3.20, h:0.7857, SE_h:0.1508, pi:0.002463, SE_pi:0.058827

H29 = [ GEDIMAPH3084, DDBJLC064946 ] ; H30 = [ GEDIMAPH3085, DDBJLC064980 ] ; H31 = [ GEDIMAPH3086, DDBJLC064981 ] ; H35 = [ GEDIMAPH3090, DDBJLC064982 ] ; H36 = [ GEDIMAPH3091, DDBJLC064983 ]
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GEDIMAP IDP1384 (個体群)
個体群名G_elongatus_elongatus_lower_Ina
魚種タモロコ Gnathopogon elongatus elongatus (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 (天竜川水系)
解析領域cyt_b (598 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Kakioka R, Kokita T, Tabata R, Mori S, Watanabe K (2012) The origins of limnetic forms and cryptic divergence in Gnathopogon fishes (Cyprinidae) in Japan. Environ. Biol. Fish. GEDIMAPR485
多様度指数A:8, ne:5.77, h:0.8857, SE_h:0.0543, pi:0.042427, SE_pi:0.150570

e1_1 = [ GEDIMAPH2239, DDBJAB677344 ] ; e1_15 = [ GEDIMAPH2253, DDBJAB677358 ] ; e1_2 = [ GEDIMAPH2240, DDBJAB677345 ] ; e3_1 = [ GEDIMAPH2321, DDBJAB677426 ] ; e3_2 = [ GEDIMAPH2322, DDBJAB677427 ] ; e3_3 = [ GEDIMAPH2323, DDBJAB677428 ] ; e3_4 = [ GEDIMAPH2324, DDBJAB677429 ] ; e3_5 = [ GEDIMAPH2325, DDBJAB677430 ]
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GEDIMAP IDP1383 (個体群)
個体群名G_elongatus_elongatus_upper_Ina
魚種タモロコ Gnathopogon elongatus elongatus (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 (天竜川水系)
解析領域cyt_b (598 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Kakioka R, Kokita T, Tabata R, Mori S, Watanabe K (2012) The origins of limnetic forms and cryptic divergence in Gnathopogon fishes (Cyprinidae) in Japan. Environ. Biol. Fish. GEDIMAPR485
多様度指数A:3, ne:1.68, h:0.4333, SE_h:0.1382, pi:0.001951, SE_pi:0.031082

e3_1 = [ GEDIMAPH2321, DDBJAB677426 ] ; e3_6 = [ GEDIMAPH2326, DDBJAB677431 ] ; e3_7 = [ GEDIMAPH2327, DDBJAB677432 ]
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GEDIMAP IDP1382 (個体群)
個体群名G_elongatus_elongatus_Nagano_Suwa
魚種タモロコ Gnathopogon elongatus elongatus (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 諏訪市 (天竜川水系)
解析領域cyt_b (598 bp)
環境情報自然湖(大規模)
移植状況明らかに移植個体群である(国内移入)
出典Kakioka R, Kokita T, Tabata R, Mori S, Watanabe K (2012) The origins of limnetic forms and cryptic divergence in Gnathopogon fishes (Cyprinidae) in Japan. Environ. Biol. Fish. GEDIMAPR485
多様度指数A:8, ne:2.34, h:0.5866, SE_h:0.0858, pi:0.001326, SE_pi:0.021096

e1_1 = [ GEDIMAPH2239, DDBJAB677344 ] ; e1_15 = [ GEDIMAPH2253, DDBJAB677358 ] ; e1_17 = [ GEDIMAPH2255, DDBJAB677360 ] ; e1_19 = [ GEDIMAPH2257, DDBJAB677362 ] ; e1_2 = [ GEDIMAPH2240, DDBJAB677345 ] ; e1_24 = [ GEDIMAPH2262, DDBJAB677367 ] ; e1_25 = [ GEDIMAPH2263, DDBJAB677368 ] ; e1_9 = [ GEDIMAPH2247, DDBJAB677352 ]
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GEDIMAP IDP1381 (個体群)
個体群名G_caerulescens_Nagano_Suwa
魚種ホンモロコ Gnathopogon caerulescens (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 諏訪市 (天竜川水系)
解析領域cyt_b (598 bp)
環境情報自然湖(大規模)
移植状況移植個体群である可能性が高い(国内移入)
出典Kakioka R, Kokita T, Tabata R, Mori S, Watanabe K (2012) The origins of limnetic forms and cryptic divergence in Gnathopogon fishes (Cyprinidae) in Japan. Environ. Biol. Fish. GEDIMAPR485
多様度指数A:9, ne:5.76, h:0.8658, SE_h:0.0437, pi:0.003084, SE_pi:0.035626

c_1 = [ GEDIMAPH2216, DDBJAB677321 ] ; c_10 = [ GEDIMAPH2225, DDBJAB677330 ] ; c_13 = [ GEDIMAPH2228, DDBJAB677333 ] ; c_18 = [ GEDIMAPH2233, DDBJAB677338 ] ; c_19 = [ GEDIMAPH2234, DDBJAB677339 ] ; c_6 = [ GEDIMAPH2221, DDBJAB677326 ] ; c_7 = [ GEDIMAPH2222, DDBJAB677327 ] ; c_8 = [ GEDIMAPH2223, DDBJAB677328 ] ; c_9 = [ GEDIMAPH2224, DDBJAB677329 ]
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GEDIMAP IDP1267 (個体群)
個体群名C_auratus_langsdorfii_Nagano_URN
魚種ギンブナ Carassius auratus langsdorfii (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 (その他水系)
解析領域CR (321 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Yamamoto, G., M. Takada, K. Iguchi and M. Nishida (2010) Genetic constitution and phylogenetic relationships of Japanese crucian carps (Carassius). Ichthyol. Res., 57: 215-222. GEDIMAPR411
多様度指数A:3, ne:3.00, h:1.0000, SE_h:0.2722, pi:0.024922, SE_pi:0.000000

AB079905 = [ GEDIMAPH2007, DDBJAB079905 ] ; AB079921 = [ GEDIMAPH2002, DDBJAB079921 ] ; AB079922 = [ GEDIMAPH1999, DDBJAB079922 ]
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GEDIMAP IDP1260 (個体群)
個体群名C_auratus_subsp_1_Nagano_URN
魚種ナガブナ Carassius auratus subsp.1 (コイ科) fish base BOLD
場所長野県 (その他水系)
解析領域CR (321 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Yamamoto, G., M. Takada, K. Iguchi and M. Nishida (2010) Genetic constitution and phylogenetic relationships of Japanese crucian carps (Carassius). Ichthyol. Res., 57: 215-222. GEDIMAPR411
多様度指数A:3, ne:3.00, h:1.0000, SE_h:0.2722, pi:0.022845, SE_pi:0.000000

AB079951 = [ GEDIMAPH2019, DDBJAB079951 ] ; AB079952 = [ GEDIMAPH2018, DDBJAB079952 ] ; AB079953 = [ GEDIMAPH2006, DDBJAB079953 ]
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GEDIMAP IDP1072 (個体群)
個体群名L_echigonia_Nagano_Kami_25
魚種ホトケドジョウ Lefua echigonia (タニノボリ科) fish base BOLD
場所長野県 茅野市湖東 (天竜川水系)
解析領域cyt_b (609 bp)
環境情報小水路
移植状況自然分布
出典北野聡・山形哲也・柳生将之・小林尚・上原武則・市川寛・美馬純一・小林健介 (2008) 長野県におけるホトケドジョウの分布・生息環境およびミトコンドリアDNAハプロタイプ. 長野県環境保全研究所研究報告,4:45-50. GEDIMAPR388
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap-A = [ GEDIMAPH1582 ]
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GEDIMAP IDP1071 (個体群)
個体群名L_echigonia_Nagano_Ta_24
魚種ホトケドジョウ Lefua echigonia (タニノボリ科) fish base BOLD
場所長野県 塩尻市片丘 (犀川水系)
解析領域cyt_b (609 bp)
環境情報小水路
移植状況自然分布
出典北野聡・山形哲也・柳生将之・小林尚・上原武則・市川寛・美馬純一・小林健介 (2008) 長野県におけるホトケドジョウの分布・生息環境およびミトコンドリアDNAハプロタイプ. 長野県環境保全研究所研究報告,4:45-50. GEDIMAPR388
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap-A = [ GEDIMAPH1582 ]
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GEDIMAP IDP1070 (個体群)
個体群名L_echigonia_Nagano_Azusa_22
魚種ホトケドジョウ Lefua echigonia (タニノボリ科) fish base BOLD
場所長野県 波田町波田 (犀川水系)
解析領域cyt_b (609 bp)
環境情報小水路
移植状況自然分布
出典北野聡・山形哲也・柳生将之・小林尚・上原武則・市川寛・美馬純一・小林健介 (2008) 長野県におけるホトケドジョウの分布・生息環境およびミトコンドリアDNAハプロタイプ. 長野県環境保全研究所研究報告,4:45-50. GEDIMAPR388
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap-A = [ GEDIMAPH1582 ]
全詳細
GEDIMAP IDP1069 (個体群)
個体群名L_echigonia_Nagano_Azusa_21
魚種ホトケドジョウ Lefua echigonia (タニノボリ科) fish base BOLD
場所長野県 松本市旧梓川村 (犀川水系)
解析領域cyt_b (609 bp)
環境情報小水路
移植状況自然分布
出典北野聡・山形哲也・柳生将之・小林尚・上原武則・市川寛・美馬純一・小林健介 (2008) 長野県におけるホトケドジョウの分布・生息環境およびミトコンドリアDNAハプロタイプ. 長野県環境保全研究所研究報告,4:45-50. GEDIMAPR388
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap-A = [ GEDIMAPH1582 ]

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