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GEDIMAP IDP2166 (個体群)
個体群名S_asotus_Kyoto_Kameoka
魚種ナマズ Silurus asotus (ナマズ科) fish base BOLD
場所京都府 亀岡市 (淀川水系)
解析領域CR (410 bp)
環境情報小水路
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:3, ne:2.58, h:0.7143, SE_h:0.1267, pi:0.011847, SE_pi:0.174374

Saso_05 = [ GEDIMAPH3713, DDBJLC097692 ] ; Saso_08 = [ GEDIMAPH3716, DDBJLC097695 ] ; Saso_12 = [ GEDIMAPH3720, DDBJLC097699 ]
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GEDIMAP IDP2165 (個体群)
個体群名S_asotus_Kyoto_Kamo
魚種ナマズ Silurus asotus (ナマズ科) fish base BOLD
場所京都府 京都市 左京区 (淀川水系)
解析領域CR (410 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Saso_10 = [ GEDIMAPH3718, DDBJLC097697 ]
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GEDIMAP IDP2122 (個体群)
個体群名Z_sieboldii_Kyoto_Fugenji
魚種ヌマムツ Zacco sieboldii (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 京田辺市 (淀川水系)
解析領域cyt_b (704 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Nsie_b05 = [ GEDIMAPH3474, DDBJLC097442 ]
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GEDIMAP IDP2121 (個体群)
個体群名Z_sieboldii_Kyoto_Sogadani
魚種ヌマムツ Zacco sieboldii (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 亀岡市 (淀川水系)
解析領域cyt_b (704 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:3, ne:3.00, h:1.0000, SE_h:0.2722, pi:0.008523, SE_pi:0.000000

Nsie_b02 = [ GEDIMAPH3471, DDBJLC097439 ] ; Nsie_b13 = [ GEDIMAPH3482, DDBJLC097450 ] ; Nsie_b15 = [ GEDIMAPH3484, DDBJLC097452 ]
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GEDIMAP IDP2085 (個体群)
個体群名P_oxycephalus_jouyi_Kyoto_Kamo
魚種タカハヤ Phoxinus oxycephalus jouyi (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 京都市 左京区 (淀川水系)
解析領域cyt_b (710 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Rojou_b02 = [ GEDIMAPH3536, DDBJLC097507 ]
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GEDIMAP IDP2039 (個体群)
個体群名C_sp__Kyoto_Kyotanabe
魚種フナ類 Carassius sp. (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 京田辺市 (淀川水系)
解析領域cyt_b (690 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:2, ne:1.80, h:0.6667, SE_h:0.3143, pi:0.010628, SE_pi:0.000000

cb25 = [ GEDIMAPH3505, DDBJLC097475 ] ; cb26 = [ GEDIMAPH2890, DDBJAB852591 ]
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GEDIMAP IDP2038 (個体群)
個体群名C_sp__Kyoto_Sakyo
魚種フナ類 Carassius sp. (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 京都市 左京区 (淀川水系)
解析領域cyt_b (690 bp)
環境情報溜池・小規模ダム
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

cb22 = [ GEDIMAPH3503, DDBJLC097472 ]
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GEDIMAP IDP1907 (個体群)
個体群名O_platypus_Hyogo_Hatta
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 (由良川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR576
多様度指数A:4, ne:3.57, h:0.9000, SE_h:0.1610, pi:0.003785, SE_pi:0.000000

WJ03 = [ GEDIMAPH3112, DDBJLC019795 ] ; WJ11 = [ GEDIMAPH3120, DDBJLC019803 ] ; WJ38 = [ GEDIMAPH3147, DDBJLC019830 ] ; WJ40 = [ GEDIMAPH3149, DDBJLC019832 ]
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GEDIMAP IDP1826 (個体群)
個体群名L_reini_Kyoto_Takeno_29
魚種アカザ Liobagrus reini (アカザ科) fish base BOLD
場所京都府 (その他水系)
解析領域cyt_b (580 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Nakagawa, N., S. Seki, T. Ishikawa and K. Watanabe (2015) Genetic population structure of the Japanese torrent catfish Liobagrus reinii (Amblycipitidae) inferred from mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res. GEDIMAPR568
多様度指数A:2, ne:1.92, h:0.6000, SE_h:0.1753, pi:0.001034, SE_pi:0.000000

H48 = [ GEDIMAPH3103, DDBJLC064957 ] ; H49 = [ GEDIMAPH3104, DDBJLC064988 ]
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GEDIMAP IDP1823 (個体群)
個体群名L_reini_Kyoto_Yura_26
魚種アカザ Liobagrus reini (アカザ科) fish base BOLD
場所京都府 美山町芦生 (由良川水系)
解析領域cyt_b (580 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Nakagawa, N., S. Seki, T. Ishikawa and K. Watanabe (2015) Genetic population structure of the Japanese torrent catfish Liobagrus reinii (Amblycipitidae) inferred from mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res. GEDIMAPR568
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

H50 = [ GEDIMAPH3105, DDBJLC064989 ]
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GEDIMAP IDP1785 (個体群)
個体群名S_variegatus_variegatus_Kameoka_Sogatani
魚種カワヒガイ Sarcocheilichthys variegatus variegatus (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 亀岡市 (淀川水系)
解析領域cyt_b (620 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR558
多様度指数A:3, ne:2.67, h:0.8333, SE_h:0.2224, pi:0.005914, SE_pi:0.000000

A001 = [ GEDIMAPH2031, DDBJAB601449 ] ; A22 = [ GEDIMAPH3003 ] ; B002 = [ GEDIMAPH2047, DDBJAB601465 ]
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GEDIMAP IDP1757 (個体群)
個体群名A_cyanostigma_Kyoto_Maruyama_12
魚種イチモンジタナゴ Acheilognathus cyanostigma (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 豊岡 (円山川水系)
解析領域cyt_b (1113 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Kitazima, J., M. Matsuda, S. Mori, T. Kokita and K. Watanabe (2014) Population structure and cryptic replacement of local populations in the endangered bitterling Acheilognathus cyanostigma. GEDIMAPR547
多様度指数A:3, ne:2.00, h:0.5238, SE_h:0.1055, pi:0.000522, SE_pi:0.014809

h01 = [ GEDIMAPH2919, DDBJAB819565 ] ; h02 = [ GEDIMAPH2920, DDBJAB819566 ] ; h07 = [ GEDIMAPH2925, DDBJAB819571 ]
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GEDIMAP IDP1756 (個体群)
個体群名A_cyanostigma_Kyoto_Yura_11
魚種イチモンジタナゴ Acheilognathus cyanostigma (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 綾部 (由良川水系)
解析領域cyt_b (1113 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Kitazima, J., M. Matsuda, S. Mori, T. Kokita and K. Watanabe (2014) Population structure and cryptic replacement of local populations in the endangered bitterling Acheilognathus cyanostigma. GEDIMAPR547
多様度指数A:2, ne:1.80, h:0.6667, SE_h:0.3143, pi:0.005391, SE_pi:0.000000

h08 = [ GEDIMAPH2926, DDBJAB819572 ] ; h11 = [ GEDIMAPH2929, DDBJAB819575 ]
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GEDIMAP IDP1753 (個体群)
個体群名A_cyanostigma_Kyoto_Heian_Shrine_8
魚種イチモンジタナゴ Acheilognathus cyanostigma (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 平安神宮 (淀川水系)
解析領域cyt_b (1113 bp)
環境情報溜池・小規模ダム
移植状況自然分布
出典Kitazima, J., M. Matsuda, S. Mori, T. Kokita and K. Watanabe (2014) Population structure and cryptic replacement of local populations in the endangered bitterling Acheilognathus cyanostigma. GEDIMAPR547
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

h02 = [ GEDIMAPH2920, DDBJAB819566 ]
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GEDIMAP IDP1698 (個体群)
個体群名S_variegatus_variegatus_Ayabe_Yura
魚種カワヒガイ Sarcocheilichthys variegatus variegatus (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 綾部市 (由良川水系)
解析領域cyt_b (620 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Komiya, T., S. Fujita-Yanagibayashi and K. Watanabe (2013) Multiple colonizations of Lake Biwa by Sarcocheilichthys fishes and their population history. Environ. Biol. Fish. DOI 10.1007/s10641-013-0176-9 GEDIMAPR539
多様度指数A:6, ne:4.55, h:0.8211, SE_h:0.0535, pi:0.007827, SE_pi:0.058208

A001 = [ GEDIMAPH2031, DDBJAB601449 ] ; B001 = [ GEDIMAPH2860, DDBJAB780983 ] ; C001 = [ GEDIMAPH2050, DDBJAB601468 ] ; D001 = [ GEDIMAPH2868, DDBJAB780991 ] ; D002 = [ GEDIMAPH2869, DDBJAB780992 ] ; D003 = [ GEDIMAPH2870, DDBJAB780993 ]
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GEDIMAP IDP1697 (個体群)
個体群名S_variegatus_variegatus_Kyoto_Kizu
魚種カワヒガイ Sarcocheilichthys variegatus variegatus (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 京田辺市 (淀川水系)
解析領域cyt_b (620 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Komiya, T., S. Fujita-Yanagibayashi and K. Watanabe (2013) Multiple colonizations of Lake Biwa by Sarcocheilichthys fishes and their population history. Environ. Biol. Fish. DOI 10.1007/s10641-013-0176-9 GEDIMAPR539
多様度指数A:2, ne:1.60, h:0.5000, SE_h:0.2652, pi:0.004839, SE_pi:0.000000

A001 = [ GEDIMAPH2031, DDBJAB601449 ] ; B002 = [ GEDIMAPH2047, DDBJAB601465 ]
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GEDIMAP IDP1462 (個体群)
個体群名G_urotaenia_Kyoto_Fukuchiyama
魚種ウキゴリ Gymnogobius urotaenia (ハゼ科) fish base BOLD
場所京都府 福知山市 (由良川水系)
解析領域cyt_b (625 bp)
環境情報河川下流
移植状況自然分布
出典Tabata, R. and K. Watanabe (2012) Hidden mitochondrial DNA divergence in the Lake Biwa endemic goby Gymnogobius isaza: implications for its evolutionary history. Environ. Biol. Fish. GEDIMAPR488
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

UR12 = [ GEDIMAPH2427, DDBJAB685557 ]
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GEDIMAP IDP1414 (個体群)
個体群名G_elongatus_elongatus_Kyoto_Takaya
魚種タモロコ Gnathopogon elongatus elongatus (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 瑞穂町 (由良川水系)
解析領域cyt_b (598 bp)
環境情報河川中流
移植状況不明
出典Kakioka R, Kokita T, Tabata R, Mori S, Watanabe K (2012) The origins of limnetic forms and cryptic divergence in Gnathopogon fishes (Cyprinidae) in Japan. Environ. Biol. Fish. GEDIMAPR485
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

e1_26 = [ GEDIMAPH2264, DDBJAB677369 ]
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GEDIMAP IDP1410 (個体群)
個体群名G_elongatus_elongatus_Kyoto_Kameoka
魚種タモロコ Gnathopogon elongatus elongatus (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 亀岡市 (その他水系)
解析領域cyt_b (598 bp)
環境情報小水路
移植状況自然分布
出典Kakioka R, Kokita T, Tabata R, Mori S, Watanabe K (2012) The origins of limnetic forms and cryptic divergence in Gnathopogon fishes (Cyprinidae) in Japan. Environ. Biol. Fish. GEDIMAPR485
多様度指数A:7, ne:4.59, h:0.8381, SE_h:0.0680, pi:0.002612, SE_pi:0.036868

e1_1 = [ GEDIMAPH2239, DDBJAB677344 ] ; e1_10 = [ GEDIMAPH2248, DDBJAB677353 ] ; e1_11 = [ GEDIMAPH2249, DDBJAB677354 ] ; e1_16 = [ GEDIMAPH2254, DDBJAB677359 ] ; e1_20 = [ GEDIMAPH2258, DDBJAB677363 ] ; e1_21 = [ GEDIMAPH2259, DDBJAB677364 ] ; e1_23 = [ GEDIMAPH2261, DDBJAB677366 ]
全詳細
GEDIMAP IDP1409 (個体群)
個体群名G_elongatus_elongatus_Kyoto_Nunome
魚種タモロコ Gnathopogon elongatus elongatus (コイ科) fish base BOLD
場所京都府 笠置町 (その他水系)
解析領域cyt_b (598 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Kakioka R, Kokita T, Tabata R, Mori S, Watanabe K (2012) The origins of limnetic forms and cryptic divergence in Gnathopogon fishes (Cyprinidae) in Japan. Environ. Biol. Fish. GEDIMAPR485
多様度指数A:2, ne:2.00, h:0.6000, SE_h:0.1291, pi:0.001003, SE_pi:0.000000

e1_1 = [ GEDIMAPH2239, DDBJAB677344 ] ; e1_4 = [ GEDIMAPH2242, DDBJAB677347 ]

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