English
個体群 [13] | ハプロタイプ [0] | 文献 [0]

13 件中 113 件を表示

13件全てマーク

全詳細
GEDIMAP IDP1766 (個体群)
個体群名H_rasborella_Osaka_18_Sakai
魚種カワバタモロコ Hemigrammocypris rasborella (コイ科) fish base BOLD
場所大阪府 堺市 (大和川水系)
解析領域cyt_b (690 bp)
環境情報溜池・小規模ダム
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., S. Mori, T. Tanaka, N. Kanagawa, T. Itai, J. Kitamura, N. Suzuki, K. Tominaga, R. Kakioka, R. Tabata, T. Abe, Y. Tashiro, Y. Hashimoto, J. Nakajima and N. Onikura (2014) Genetic population structure of Hemigrammocypris rasborella (Cyprinidae) inferred from mtDNA sequences. Ichthyol. Res. GEDIMAPR550
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

h36 = [ GEDIMAPH2967, DDBJAB907302 ]
全詳細
GEDIMAP IDP1765 (個体群)
個体群名H_rasborella_Osaka_17_Taishi
魚種カワバタモロコ Hemigrammocypris rasborella (コイ科) fish base BOLD
場所大阪府 太子町 (大和川水系)
解析領域cyt_b (690 bp)
環境情報溜池・小規模ダム
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., S. Mori, T. Tanaka, N. Kanagawa, T. Itai, J. Kitamura, N. Suzuki, K. Tominaga, R. Kakioka, R. Tabata, T. Abe, Y. Tashiro, Y. Hashimoto, J. Nakajima and N. Onikura (2014) Genetic population structure of Hemigrammocypris rasborella (Cyprinidae) inferred from mtDNA sequences. Ichthyol. Res. GEDIMAPR550
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

h36 = [ GEDIMAPH2967, DDBJAB907302 ]
全詳細
GEDIMAP IDP1754 (個体群)
個体群名A_cyanostigma_Osaka_Yodo_9
魚種イチモンジタナゴ Acheilognathus cyanostigma (コイ科) fish base BOLD
場所大阪府 (淀川水系)
解析領域cyt_b (1113 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Kitazima, J., M. Matsuda, S. Mori, T. Kokita and K. Watanabe (2014) Population structure and cryptic replacement of local populations in the endangered bitterling Acheilognathus cyanostigma. GEDIMAPR547
多様度指数A:2, ne:1.60, h:0.3947, SE_h:0.1006, pi:0.000355, SE_pi:0.012360

h01 = [ GEDIMAPH2919, DDBJAB819565 ] ; h02 = [ GEDIMAPH2920, DDBJAB819566 ]
全詳細
GEDIMAP IDP1646 (個体群)
個体群名A_logipinnis_Shirokita
魚種イタセンパラ Acheilognathus logipinnis (コイ科) fish base BOLD
場所大阪府 (淀川水系)
解析領域12S_rRNA, ND2 (1447 bp)
環境情報河川下流
移植状況自然分布
出典Kitanishi, S., M. Nishio, K. Uehara, R. Ogawa, T. Yokoyama and K. Edo (2013) Patterns of genetic diversity of mitochondrial DNA within captive populations of the endangered itasenpara bitterling: implications for a reintroduction program. Environ. Biol. Fish., 96:567-572 GEDIMAPR504
多様度指数A:11, ne:2.70, h:0.6427, SE_h:0.0599, pi:0.000999, SE_pi:0.018026

Seq1 = [ GEDIMAPH2777, DDBJAB668480,AB668481 ] ; Seq10 = [ GEDIMAPH2786 ] ; Seq11 = [ GEDIMAPH2787 ] ; Seq12 = [ GEDIMAPH2788 ] ; Seq13 = [ GEDIMAPH2789 ] ; Seq14 = [ GEDIMAPH2790 ] ; Seq15 = [ GEDIMAPH2791 ] ; Seq4 = [ GEDIMAPH2780 ] ; Seq5 = [ GEDIMAPH2781 ] ; Seq8 = [ GEDIMAPH2784 ] ; Seq9 = [ GEDIMAPH2785 ]
全詳細
GEDIMAP IDP1645 (個体群)
個体群名A_logipinnis_Yodo-D
魚種イタセンパラ Acheilognathus logipinnis (コイ科) fish base BOLD
場所大阪府 (淀川水系)
解析領域12S_rRNA, ND2 (1447 bp)
環境情報河川下流
移植状況飼育集団
出典Kitanishi, S., M. Nishio, K. Uehara, R. Ogawa, T. Yokoyama and K. Edo (2013) Patterns of genetic diversity of mitochondrial DNA within captive populations of the endangered itasenpara bitterling: implications for a reintroduction program. Environ. Biol. Fish., 96:567-572 GEDIMAPR504
多様度指数A:2, ne:1.88, h:0.5357, SE_h:0.1232, pi:0.000370, SE_pi:0.022791

Seq1 = [ GEDIMAPH2777, DDBJAB668480,AB668481 ] ; Seq7 = [ GEDIMAPH2783 ]
全詳細
GEDIMAP IDP1644 (個体群)
個体群名A_logipinnis_Yodo-C
魚種イタセンパラ Acheilognathus logipinnis (コイ科) fish base BOLD
場所大阪府 (淀川水系)
解析領域12S_rRNA, ND2 (1447 bp)
環境情報河川下流
移植状況飼育集団
出典Kitanishi, S., M. Nishio, K. Uehara, R. Ogawa, T. Yokoyama and K. Edo (2013) Patterns of genetic diversity of mitochondrial DNA within captive populations of the endangered itasenpara bitterling: implications for a reintroduction program. Environ. Biol. Fish., 96:567-572 GEDIMAPR504
多様度指数A:4, ne:3.96, h:0.7751, SE_h:0.0242, pi:0.000803, SE_pi:0.017303

Seq1 = [ GEDIMAPH2777, DDBJAB668480,AB668481 ] ; Seq2 = [ GEDIMAPH2778 ] ; Seq3 = [ GEDIMAPH2779 ] ; Seq7 = [ GEDIMAPH2783 ]
全詳細
GEDIMAP IDP1643 (個体群)
個体群名A_logipinnis_Yodo-B
魚種イタセンパラ Acheilognathus logipinnis (コイ科) fish base BOLD
場所大阪府 (淀川水系)
解析領域12S_rRNA, ND2 (1447 bp)
環境情報河川下流
移植状況飼育集団
出典Kitanishi, S., M. Nishio, K. Uehara, R. Ogawa, T. Yokoyama and K. Edo (2013) Patterns of genetic diversity of mitochondrial DNA within captive populations of the endangered itasenpara bitterling: implications for a reintroduction program. Environ. Biol. Fish., 96:567-572 GEDIMAPR504
多様度指数A:4, ne:2.30, h:0.5947, SE_h:0.0977, pi:0.000604, SE_pi:0.016128

Seq1 = [ GEDIMAPH2777, DDBJAB668480,AB668481 ] ; Seq11 = [ GEDIMAPH2787 ] ; Seq2 = [ GEDIMAPH2778 ] ; Seq6 = [ GEDIMAPH2782 ]
全詳細
GEDIMAP IDP1642 (個体群)
個体群名A_logipinnis_Yodo-A
魚種イタセンパラ Acheilognathus logipinnis (コイ科) fish base BOLD
場所大阪府 (淀川水系)
解析領域12S_rRNA, ND2 (1447 bp)
環境情報河川下流
移植状況飼育集団
出典Kitanishi, S., M. Nishio, K. Uehara, R. Ogawa, T. Yokoyama and K. Edo (2013) Patterns of genetic diversity of mitochondrial DNA within captive populations of the endangered itasenpara bitterling: implications for a reintroduction program. Environ. Biol. Fish., 96:567-572 GEDIMAPR504
多様度指数A:4, ne:3.84, h:0.7717, SE_h:0.0320, pi:0.000997, SE_pi:0.019854

Seq1 = [ GEDIMAPH2777, DDBJAB668480,AB668481 ] ; Seq11 = [ GEDIMAPH2787 ] ; Seq3 = [ GEDIMAPH2779 ] ; Seq6 = [ GEDIMAPH2782 ]
全詳細
GEDIMAP IDP1184 (個体群)
個体群名B_zezera_Osaka_Akuta_13_YOD3
魚種ゼゼラ Biwia zezera (コイ科) fish base BOLD
場所大阪府 高槻 (淀川水系)
解析領域cyt_b (651 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., S. Kawase, T. Mukai, R. Kakioka, J.-I. Miyazaki and K. Hosoya (2010) Population divergence of Biwia zezera (Cyprinidae: Gobioninae) and the discovery of a cryptic species, based on mitochondrial and nuclear DNA sequence analyses. Zool. Sci., 27:647-655 GEDIMAPR403
多様度指数A:3, ne:2.00, h:0.6000, SE_h:0.2152, pi:0.001024, SE_pi:0.000000

ZYD01 = [ GEDIMAPH1753 ] ; ZYD02 = [ GEDIMAPH1754 ] ; ZYD04 = [ GEDIMAPH1756 ]
全詳細
GEDIMAP IDP973 (個体群)
個体群名O_latipes_Osaka_Izumi
魚種メダカ Oryzias latipes (メダカ科) fish base BOLD
場所大阪府 和泉市 (その他水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Takehana, Y., N. Nagai, M. Matsuda, K. Tsuchiya, and M. Sakaizumi (2003) Geographic variation and diversity of the cytochrome b gene in Japanese wild populations of medaka, Oryzias latipes. Zool. Sci., 20: 1279-1291 GEDIMAPR199
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

B6_Izumi = [ GEDIMAPH1468, DDBJAB084705 ]
全詳細
GEDIMAP IDP445 (個体群)
個体群名R_ocellatus_kurumeus_Osaka_Yao1
魚種ニッポンバラタナゴ Rhodeus ocellatus kurumeus (コイ科) fish base BOLD
場所大阪府 大阪府八尾市 (大和川水系)
解析領域ND1 (975 bp)
環境情報溜池・小規模ダム
移植状況自然分布
出典三宅琢也・河村功一・細谷和海・岡崎登志夫・北川忠生 (2007) 奈良県内で確認されたニッポンバラタナゴ. 魚類学雑誌, 54(2): 225-230 GEDIMAPR286
多様度指数A:4, ne:4.00, h:1.0000, SE_h:0.1768, pi:0.001538, SE_pi:0.000000

RoK1_4_6 = [ GEDIMAPH781, DDBJAB262802 ] ; RoK2 = [ GEDIMAPH782 ] ; RoK3 = [ GEDIMAPH783 ]
全詳細
GEDIMAP IDP369 (個体群)
個体群名R_ocellatus_kurumeus_Osaka_Yao_369
魚種ニッポンバラタナゴ Rhodeus ocellatus kurumeus (コイ科) fish base BOLD
場所大阪府 八尾市 (その他水系)
解析領域cyt_b (224 bp)
環境情報溜池・小規模ダム
移植状況自然分布
出典Miyake, K., H. Tachida, Y. Oshima, R. Arai, S. Kimura, N. Imada and T. Honjo (2001) Genetic variation of the cytochrome b gene in the rosy bitterling, Rhodeus ocellatus (Cyprinidae) in Japan. Ichthyol. Res., 48: 105-110 GEDIMAPR153
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Yao1 = [ GEDIMAPH679, DDBJAB033737 ]
全詳細
GEDIMAP IDP355 (個体群)
個体群名R_ocellatus_kurumeus_Osaka_Yao
魚種ニッポンバラタナゴ Rhodeus ocellatus kurumeus (コイ科) fish base BOLD
場所大阪府 八尾市 (大和川水系)
解析領域12S_rRNA (709 bp)
環境情報溜池・小規模ダム
移植状況自然分布
出典Okazaki, M., K. Naruse, A. Shima and R. Arai (2001) Phylogenetic relationships of bitterlings based on mitochondrial 12S ribosomal DNA sequences. J. Fish Biol., 58: 89-106 GEDIMAPR155
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Rokurumeus = [ GEDIMAPH601, DDBJAB016696 ]

____________