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GEDIMAP IDP2240 (個体群)
個体群名T_hakonensis_28_Koza
魚種ウグイ Tribolodon hakonensis (コイ科) fish base BOLD
場所和歌山県 (その他水系)
解析領域cyt_b (758 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., H. Sakai, T. Sanada and M. Nishida (2018) Comparative phylogeography of diadromous and freshwater daces of the genus Tribolodon (Cyprinidae). Ichthyol Res., 65 GEDIMAPR603
多様度指数A:3, ne:2.67, h:0.8333, SE_h:0.2224, pi:0.001319, SE_pi:0.000000

h54 = [ GEDIMAPH3912, DDBJLC277482 ] ; h56 = [ GEDIMAPH3914, DDBJLC277518 ] ; h57 = [ GEDIMAPH3915, DDBJLC277520 ]
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GEDIMAP IDP1911 (個体群)
個体群名O_platypus_Wakayama_Sumiyoshi
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所和歌山県 (紀ノ川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR577
多様度指数A:2, ne:1.96, h:0.5714, SE_h:0.1195, pi:0.005122, SE_pi:0.114393

WJ15 = [ GEDIMAPH3124, DDBJLC019807 ] ; WJ67 = [ GEDIMAPH3176, DDBJLC019859 ]
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GEDIMAP IDP1910 (個体群)
個体群名O_platypus_Wakayama_Kamenokawa
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所和歌山県 (その他水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR577
多様度指数A:2, ne:1.53, h:0.3889, SE_h:0.1644, pi:0.003486, SE_pi:0.059782

WJ15 = [ GEDIMAPH3124, DDBJLC019807 ] ; WJ67 = [ GEDIMAPH3176, DDBJLC019859 ]
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GEDIMAP IDP1824 (個体群)
個体群名L_reini_Wakayama_Arida_27
魚種アカザ Liobagrus reini (アカザ科) fish base BOLD
場所和歌山県 (有田川水系)
解析領域cyt_b (580 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Nakagawa, N., S. Seki, T. Ishikawa and K. Watanabe (2015) Genetic population structure of the Japanese torrent catfish Liobagrus reinii (Amblycipitidae) inferred from mitochondrial cytochrome b variations. Ichthyol. Res. GEDIMAPR568
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

H05 = [ GEDIMAPH3060, DDBJLC064933 ]
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GEDIMAP IDP1612 (個体群)
個体群名A_rivularis_Wakayama_Wakayama_HS_J8
魚種ツチフキ Abbottina rivularis (コイ科) fish base BOLD
場所和歌山県 和歌山市 (紀ノ川水系)
解析領域cyt_b (1052 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR508
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

AR-h59 = [ GEDIMAPH2741, DDBJJX137576,JX137577,JX137578,JX137579,JX137580,JX137581,JX137582,JX137583,JX137584,JX137585,JX137586,JX137587,JX137588,JX137589,JX137590,JX137591,JX137592,JX137593,JX137595,JX137596,JX137597,JX137598,JX137600,JX137601,JX137603 ]
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GEDIMAP IDP1415 (個体群)
個体群名G_elongatus_elongatus_Wakayama_Katsuragi
魚種タモロコ Gnathopogon elongatus elongatus (コイ科) fish base BOLD
場所和歌山県 かつらぎ町 (紀ノ川水系)
解析領域cyt_b (598 bp)
環境情報小水路
移植状況自然分布
出典Kakioka R, Kokita T, Tabata R, Mori S, Watanabe K (2012) The origins of limnetic forms and cryptic divergence in Gnathopogon fishes (Cyprinidae) in Japan. Environ. Biol. Fish. GEDIMAPR485
多様度指数A:4, ne:1.71, h:0.4545, SE_h:0.1701, pi:0.001115, SE_pi:0.026818

e1_1 = [ GEDIMAPH2239, DDBJAB677344 ] ; e1_15 = [ GEDIMAPH2253, DDBJAB677358 ] ; e1_28 = [ GEDIMAPH2266, DDBJAB677371 ] ; e1_3 = [ GEDIMAPH2241, DDBJAB677346 ]
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GEDIMAP IDP1247 (個体群)
個体群名L_petersii_Wakayama_25_NA
魚種シロウオ Leucopsarion petersii (ハゼ科) fish base BOLD
場所和歌山県 那智勝浦 (その他水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報汽水
移植状況自然分布
出典Kokita, T. and K. Nohara (2011) Phylogeography and historical demography of the anadromous fish Leucopsarion petersii in relation to geological history and oceanography around the Japanese Archipelago. Molecular Ecology, 20: 143-164. GEDIMAPR431
多様度指数A:5, ne:5.00, h:1.0000, SE_h:0.1265, pi:0.008238, SE_pi:0.000000

H91 = [ GEDIMAPH1962, DDBJAB562246 ] ; H92 = [ GEDIMAPH1963, DDBJAB562247 ] ; H93 = [ GEDIMAPH1964, DDBJAB562248 ] ; H94 = [ GEDIMAPH1965, DDBJAB562249 ] ; H95 = [ GEDIMAPH1966, DDBJAB562250 ]
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GEDIMAP IDP1246 (個体群)
個体群名L_petersii_Wakayama_24_YU
魚種シロウオ Leucopsarion petersii (ハゼ科) fish base BOLD
場所和歌山県 湯浅 (その他水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報汽水
移植状況自然分布
出典Kokita, T. and K. Nohara (2011) Phylogeography and historical demography of the anadromous fish Leucopsarion petersii in relation to geological history and oceanography around the Japanese Archipelago. Molecular Ecology, 20: 143-164. GEDIMAPR431
多様度指数A:5, ne:5.00, h:1.0000, SE_h:0.1265, pi:0.010342, SE_pi:0.000000

H32 = [ GEDIMAPH1903, DDBJAB562187 ] ; H6 = [ GEDIMAPH1877, DDBJAB562161 ] ; H66 = [ GEDIMAPH1937, DDBJAB562221 ] ; H89 = [ GEDIMAPH1960, DDBJAB562244 ] ; H90 = [ GEDIMAPH1961, DDBJAB562245 ]
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GEDIMAP IDP1075 (個体群)
個体群名S_japonicus_Wakayama_WAK
魚種ボウズハゼ Sicyopterus japonicus (ハゼ科) fish base BOLD
場所和歌山県 (その他水系)
解析領域CR (448 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Watanabe, S., M. Iida, Y. Kimura, E. Feunteun and K. Tsukamoto (2006) Genetic diversity of Sicyopterus japonicus as revealed by mitochondrial DNA sequencing. Coastal Marine Science 30: 473-479. GEDIMAPR391
多様度指数A:27, ne:26.13, h:0.9974, SE_h:0.0099, pi:0.016233, SE_pi:0.078216

29 = [ GEDIMAPH1612, DDBJAB245168 ] ; 46 = [ GEDIMAPH1629, DDBJAB245185 ] ; 47 = [ GEDIMAPH1630, DDBJAB245186 ] ; 48 = [ GEDIMAPH1631, DDBJAB245187 ] ; 49 = [ GEDIMAPH1632, DDBJAB245188 ] ; 50 = [ GEDIMAPH1633, DDBJAB245189 ] ; 51 = [ GEDIMAPH1634, DDBJAB245190 ] ; 52 = [ GEDIMAPH1635, DDBJAB245191 ] ; 53 = [ GEDIMAPH1636, DDBJAB245192 ] ; 54 = [ GEDIMAPH1637, DDBJAB245193 ] ; 55 = [ GEDIMAPH1657, DDBJAB245194 ] ; 56 = [ GEDIMAPH1638, DDBJAB245195 ] ; 57 = [ GEDIMAPH1639, DDBJAB245196 ] ; 58 = [ GEDIMAPH1640, DDBJAB245197 ] ; 59 = [ GEDIMAPH1641, DDBJAB245198 ] ; 60 = [ GEDIMAPH1642, DDBJAB245199 ] ; 61 = [ GEDIMAPH1643, DDBJAB245200 ] ; 62 = [ GEDIMAPH1644, DDBJAB245201 ] ; 63 = [ GEDIMAPH1645, DDBJAB245202 ] ; 64 = [ GEDIMAPH1646, DDBJAB245203 ] ; 65 = [ GEDIMAPH1647, DDBJAB245204 ] ; 66 = [ GEDIMAPH1648, DDBJAB245205 ] ; 67 = [ GEDIMAPH1649, DDBJAB245206 ] ; 68 = [ GEDIMAPH1650, DDBJAB245207 ] ; 69 = [ GEDIMAPH1651, DDBJAB245208 ] ; 70 = [ GEDIMAPH1652, DDBJAB245209 ] ; 71 = [ GEDIMAPH1653, DDBJAB245210 ]
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GEDIMAP IDP982 (個体群)
個体群名O_latipes_Wakayama_Hikigawa
魚種メダカ Oryzias latipes (メダカ科) fish base BOLD
場所和歌山県 西牟婁郡白浜町(旧日置川町) (その他水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Takehana, Y., N. Nagai, M. Matsuda, K. Tsuchiya, and M. Sakaizumi (2003) Geographic variation and diversity of the cytochrome b gene in Japanese wild populations of medaka, Oryzias latipes. Zool. Sci., 20: 1279-1291 GEDIMAPR199
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

B10_Hikiga = [ GEDIMAPH1472, DDBJAB084709 ]
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GEDIMAP IDP981 (個体群)
個体群名O_latipes_Wakayama_Shingu
魚種メダカ Oryzias latipes (メダカ科) fish base BOLD
場所和歌山県 新宮市 (新宮川水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Takehana, Y., N. Nagai, M. Matsuda, K. Tsuchiya, and M. Sakaizumi (2003) Geographic variation and diversity of the cytochrome b gene in Japanese wild populations of medaka, Oryzias latipes. Zool. Sci., 20: 1279-1291 GEDIMAPR199
多様度指数A:3, ne:3.00, h:1.0000, SE_h:0.2722, pi:0.019281, SE_pi:0.000000

B33_Kumano = [ GEDIMAPH1499, DDBJAB084737 ] ; B33_Shingu = [ GEDIMAPH1500, DDBJAB084738 ] ; B41_Shingu = [ GEDIMAPH1508, DDBJAB084746 ]
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GEDIMAP IDP980 (個体群)
個体群名O_latipes_Wakayama_Hongu
魚種メダカ Oryzias latipes (メダカ科) fish base BOLD
場所和歌山県 田辺市本宮町(旧東牟婁郡本宮町) (新宮川水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Takehana, Y., N. Nagai, M. Matsuda, K. Tsuchiya, and M. Sakaizumi (2003) Geographic variation and diversity of the cytochrome b gene in Japanese wild populations of medaka, Oryzias latipes. Zool. Sci., 20: 1279-1291 GEDIMAPR199
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

B11_Hongu = [ GEDIMAPH1474, DDBJAB084711 ]
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GEDIMAP IDP840 (個体群)
個体群名P_esocinus_esocinus_Wakayama_Kimino_WB-4
魚種カマツカ Pseudogobio esocinus esocinus (コイ科) fish base BOLD
場所和歌山県 紀美野町 (紀ノ川水系)
解析領域cyt_b (689 bp)
環境情報河川中流
移植状況自然分布
出典Tominaga, K., K. Watanabe, R. Kakioka, S. Mori and S-R. Jeon (2009) Two highly divergent mitochondrial DNA lineages within Pseudogobio esocinus populations in central Honshu, Japan. Ichthyol. Res., 56: 195-199. GEDIMAPR345
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

1Bw13 = [ GEDIMAPH1254, DDBJAB426301 ]
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GEDIMAP IDP474 (個体群)
個体群名C_tanegasimae_Wakayama_Yukashigata
魚種タネハゼ Callogobius tanegasimae (ハゼ科) fish base BOLD
場所和歌山県 那智勝浦町 (その他水系)
解析領域ND5 (1036 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典向井貴彦 (2006) 日本-琉球列島のタネハゼにおけるミトコンドリアDNAの種内系統. 日本生物地理学会会報, 61; 45-49. GEDIMAPR265
多様度指数A:4, ne:4.00, h:1.0000, SE_h:0.1768, pi:0.004183, SE_pi:0.000000

Yukashi1 = [ GEDIMAPH803, DDBJAB269893 ] ; Yukashi2 = [ GEDIMAPH804, DDBJAB269894 ] ; Yukashi3 = [ GEDIMAPH805, DDBJAB269895 ] ; Yukashi4 = [ GEDIMAPH806, DDBJAB269896 ]
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GEDIMAP IDP473 (個体群)
個体群名C_tanegasimae_Wakayama_Kirime
魚種タネハゼ Callogobius tanegasimae (ハゼ科) fish base BOLD
場所和歌山県 印南町 (その他水系)
解析領域ND5 (1036 bp)
環境情報汽水
移植状況自然分布
出典向井貴彦 (2006) 日本-琉球列島のタネハゼにおけるミトコンドリアDNAの種内系統. 日本生物地理学会会報, 61; 45-49. GEDIMAPR265
多様度指数A:3, ne:3.00, h:1.0000, SE_h:0.2722, pi:0.005148, SE_pi:0.000000

Kirime1 = [ GEDIMAPH795, DDBJAB259863 ] ; Kirime2 = [ GEDIMAPH796, DDBJAB259864 ] ; Kirime3 = [ GEDIMAPH802, DDBJAB269892 ]
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GEDIMAP IDP338 (個体群)
個体群名L_guttatus_Wakayama_Kirime
魚種ミミズハゼ Luciogobius guttatus (ハゼ科) fish base BOLD
場所和歌山県 印南町 (その他水系)
解析領域12S_rRNA, 16S_rRNA (1047 bp)
環境情報汽水
移植状況自然分布
出典向井貴彦・西田 睦 (2004) 日本産ミミズハゼにおけるミトコンドリアDNAの系統と地理的分化. 魚類学雑誌,51:157?161 GEDIMAPR217
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

LgKirime = [ GEDIMAPH516, DDBJAB121998,AB121999 ]
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GEDIMAP IDP304 (個体群)
個体群名R_sp__DA_Wakayama
魚種クロヨシノボリ(黒色型) Rhinogobius sp. DA (ハゼ科) fish base BOLD
場所和歌山県 串本 (その他水系)
解析領域ND5 (945 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Mukai, T., S. Nakamura, T. Suzuki and M. Nishida (2005) Mitochondrial DNA divergence in yoshinobori gobies (Rhinogobius species complex) between the Bonin Islands and the Japan-Ryukyu Archipelago. Ichthyol. Res., 52: 410-413 GEDIMAPR239
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

RspDAWakay = [ GEDIMAPH464, DDBJAB190330 ]
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GEDIMAP IDP251 (個体群)
個体群名L_sp__Wakayama_Nakatsu
魚種ナガレホトケドジョウ Lefua sp. (タニノボリ科) fish base BOLD
場所和歌山県 日高川町 (旧中津村) (日高川水系)
解析領域CR (911 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Sakai, T., M. Mihara, H. Shitara, H. Yonekawa, K. Hosoya and J. Miyazaki (2003) Phylogenetic relationships and intraspecific variations of loaches of the genus Lefua (Balitoridae, Cypriniformes). Zool. Sci., 20: 501-514 GEDIMAPR196
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

NakatsuLsp = [ GEDIMAPH290, DDBJAB102819 ]
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GEDIMAP IDP179 (個体群)
個体群名M_abei_Wakayama_Wakayama
魚種アベハゼ Mugilogobius abei (ハゼ科) fish base BOLD
場所和歌山県 和歌山市 和歌浦 (その他水系)
解析領域12S_rRNA (713 bp)
環境情報汽水
移植状況自然分布
出典Mukai, T., M. Kajimura and K. Iwata (2000) Evolution of a ureagenic ability of Japanese Mugilogobius species (Pisces: Gobiidae). Zool. Sci., 17: 549-557 GEDIMAPR147
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Mabei = [ GEDIMAPH357, DDBJAB022893 ]

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