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GEDIMAP IDP2092 (個体群)
個体群名P_oxycephalus_jouyi_Midori
魚種タカハヤ Phoxinus oxycephalus jouyi (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (緑川水系)
解析領域cyt_b (710 bp)
環境情報自然池沼
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Rojou_c03 = [ GEDIMAPH3543, DDBJLC097514 ]
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GEDIMAP IDP2091 (個体群)
個体群名P_oxycephalus_jouyi_Kumamoto_2091
魚種タカハヤ Phoxinus oxycephalus jouyi (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (その他水系)
解析領域cyt_b (710 bp)
環境情報小水路
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Rojou_c07 = [ GEDIMAPH3547, DDBJLC097518 ]
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GEDIMAP IDP2090 (個体群)
個体群名P_oxycephalus_jouyi_Kumamoto
魚種タカハヤ Phoxinus oxycephalus jouyi (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (その他水系)
解析領域cyt_b (710 bp)
環境情報小水路
移植状況自然分布
出典Tabata, R., R. Kakioka, K. Tominaga, T. Komiya and K. Watanabe (2016) . Evol. Ecol. GEDIMAPR586
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Rojou_c06 = [ GEDIMAPH3546, DDBJLC097517 ]
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GEDIMAP IDP1956 (個体群)
個体群名O_platypus_Kumamoto_YatsushiroCreek
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (球磨川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報小水路
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR579
多様度指数A:5, ne:3.20, h:0.7857, SE_h:0.1508, pi:0.002241, SE_pi:0.056108

KY18 = [ GEDIMAPH3288, DDBJLC019972 ] ; KY19 = [ GEDIMAPH3289, DDBJLC019973 ] ; KY31 = [ GEDIMAPH3301, DDBJLC019985 ] ; KY32 = [ GEDIMAPH3302, DDBJLC019986 ] ; KY33 = [ GEDIMAPH3303, DDBJLC019987 ]
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GEDIMAP IDP1955 (個体群)
個体群名O_platypus_Kumamoto_Ryusou
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (球磨川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR579
多様度指数A:4, ne:2.29, h:0.6429, SE_h:0.1841, pi:0.013197, SE_pi:0.136675

KY19 = [ GEDIMAPH3289, DDBJLC019973 ] ; KY30 = [ GEDIMAPH3300, DDBJLC019984 ] ; WJ104 = [ GEDIMAPH3212, DDBJLC019896 ] ; WJ66 = [ GEDIMAPH3175, DDBJLC019858 ]
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GEDIMAP IDP1954 (個体群)
個体群名O_platypus_Kumamoto_Suna
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (その他水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR579
多様度指数A:2, ne:1.80, h:0.6667, SE_h:0.3143, pi:0.003320, SE_pi:0.000000

KY04 = [ GEDIMAPH3274, DDBJLC019958 ] ; KY05 = [ GEDIMAPH3275, DDBJLC019959 ]
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GEDIMAP IDP1953 (個体群)
個体群名O_platypus_Kumamoto_Kase
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (緑川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR579
多様度指数A:5, ne:2.81, h:0.7091, SE_h:0.1366, pi:0.002354, SE_pi:0.041204

KY03 = [ GEDIMAPH3273, DDBJLC019957 ] ; KY05 = [ GEDIMAPH3275, DDBJLC019959 ] ; KY12 = [ GEDIMAPH3282, DDBJLC019966 ] ; KY15 = [ GEDIMAPH3285, DDBJLC019969 ] ; KY16 = [ GEDIMAPH3286, DDBJLC019970 ]
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GEDIMAP IDP1952 (個体群)
個体群名O_platypus_Kumamoto_Toyota
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (菊池川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR579
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.031873, SE_pi:0.000000

KY20 = [ GEDIMAPH3290, DDBJLC019974 ] ; WJ24 = [ GEDIMAPH3133, DDBJLC019816 ]
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GEDIMAP IDP1951 (個体群)
個体群名O_platypus_Kumamoto_Myojin
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (菊池川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR579
多様度指数A:9, ne:5.26, h:0.8526, SE_h:0.0607, pi:0.003675, SE_pi:0.039829

KY02 = [ GEDIMAPH3272, DDBJLC019956 ] ; KY03 = [ GEDIMAPH3273, DDBJLC019957 ] ; KY05 = [ GEDIMAPH3275, DDBJLC019959 ] ; KY13 = [ GEDIMAPH3283, DDBJLC019967 ] ; KY14 = [ GEDIMAPH3284, DDBJLC019968 ] ; KY15 = [ GEDIMAPH3285, DDBJLC019969 ] ; KY16 = [ GEDIMAPH3286, DDBJLC019970 ] ; KY21 = [ GEDIMAPH3291, DDBJLC019975 ] ; KY27 = [ GEDIMAPH3297, DDBJLC019981 ]
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GEDIMAP IDP1950 (個体群)
個体群名O_platypus_Kumamoto_Kikuchi
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (菊池川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR579
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.006972, SE_pi:0.000000

KY05 = [ GEDIMAPH3275, DDBJLC019959 ] ; KY16 = [ GEDIMAPH3286, DDBJLC019970 ]
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GEDIMAP IDP1760 (個体群)
個体群名A_cyanostigma_Kumamoto_Lake_Ezu_15
魚種イチモンジタナゴ Acheilognathus cyanostigma (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 熊本 (緑川水系)
解析領域cyt_b (1113 bp)
環境情報ダム湖
移植状況明らかに移植個体群である(国内移入)
出典Kitazima, J., M. Matsuda, S. Mori, T. Kokita and K. Watanabe (2014) Population structure and cryptic replacement of local populations in the endangered bitterling Acheilognathus cyanostigma. GEDIMAPR547
多様度指数A:2, ne:1.41, h:0.3088, SE_h:0.1222, pi:0.000277, SE_pi:0.011471

h01 = [ GEDIMAPH2919, DDBJAB819565 ] ; h02 = [ GEDIMAPH2920, DDBJAB819566 ]
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GEDIMAP IDP1624 (個体群)
個体群名A_rivularis_Kumamoto_Tamana_KS_J20
魚種ツチフキ Abbottina rivularis (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 玉名市 (その他水系)
解析領域cyt_b (1052 bp)
環境情報不明
移植状況不明
出典 未発表データ: GEDIMAPR508
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

h51 = [ GEDIMAPH2747, DDBJJX137620,JX137621,JX137622,JX137623,JX137624,JX137625,JX137626,JX137627,JX137628,JX137631,JX137633,JX137634,JX137636,JX137637,JX137638,JX137639,JX137640,JX137641,JX137642,JX137643,JX137644,JX137645,JX137646,JX137647,JX137657,JX137658,JX137659,JX137660,JX137661,JX137662,JX137663,JX137665,JX137666,JX137667,JX137668,JX137669,JX137670,JX137671,JX137672,JX137673,JX137674,JX137675,JX137676 ]
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GEDIMAP IDP1623 (個体群)
個体群名A_rivularis_Kumamoto_Nagasu_KS_J19
魚種ツチフキ Abbottina rivularis (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 長洲町 (その他水系)
解析領域cyt_b (1052 bp)
環境情報不明
移植状況不明
出典 未発表データ: GEDIMAPR508
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

h51 = [ GEDIMAPH2747, DDBJJX137620,JX137621,JX137622,JX137623,JX137624,JX137625,JX137626,JX137627,JX137628,JX137631,JX137633,JX137634,JX137636,JX137637,JX137638,JX137639,JX137640,JX137641,JX137642,JX137643,JX137644,JX137645,JX137646,JX137647,JX137657,JX137658,JX137659,JX137660,JX137661,JX137662,JX137663,JX137665,JX137666,JX137667,JX137668,JX137669,JX137670,JX137671,JX137672,JX137673,JX137674,JX137675,JX137676 ]
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GEDIMAP IDP1622 (個体群)
個体群名A_rivularis_Kumamoto_Arao_KS_J18
魚種ツチフキ Abbottina rivularis (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 荒尾市 (その他水系)
解析領域cyt_b (1052 bp)
環境情報不明
移植状況不明
出典 未発表データ: GEDIMAPR508
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

h51 = [ GEDIMAPH2747, DDBJJX137620,JX137621,JX137622,JX137623,JX137624,JX137625,JX137626,JX137627,JX137628,JX137631,JX137633,JX137634,JX137636,JX137637,JX137638,JX137639,JX137640,JX137641,JX137642,JX137643,JX137644,JX137645,JX137646,JX137647,JX137657,JX137658,JX137659,JX137660,JX137661,JX137662,JX137663,JX137665,JX137666,JX137667,JX137668,JX137669,JX137670,JX137671,JX137672,JX137673,JX137674,JX137675,JX137676 ]
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GEDIMAP IDP1486 (個体群)
個体群名O_latipes_Kumamoto_S20
魚種メダカ Oryzias latipes (メダカ科) fish base BOLD
場所熊本県 (その他水系)
解析領域cyt_b (1104 bp)
環境情報不明
移植状況飼育集団
出典小山直人・森幹大・中井宏施・北川忠生 (2011) 市販されているメダカのミトコンドリアDNA遺伝子構成. 魚類学雑誌, 58(1):81-86 GEDIMAPR472
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

B27HdrR_1104 = [ GEDIMAPH2470, DDBJAB084753 ]
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GEDIMAP IDP1448 (個体群)
個体群名C_pollux_ME_16
魚種カジカ類 Cottus sp. (カジカ科) fish base BOLD
場所熊本県 (氷川水系)
解析領域CR (387 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Tsukagoshi, H., R. Yokoyama and A. Goto (2011) Mitochondrial DNA analysis reveals a unique population structure of the amphidromous sculpin Cottus pollux middle-egg type (Teleostei: Cottidae). Mol. Phylogenet. Evol., 60: 265-270. GEDIMAPR486
多様度指数A:4, ne:1.37, h:0.2842, SE_h:0.1284, pi:0.001550, SE_pi:0.025852

M11 = [ GEDIMAPH2337, DDBJAB605406 ] ; M15 = [ GEDIMAPH2339, DDBJAB605408 ] ; M17 = [ GEDIMAPH2340, DDBJAB605410 ] ; M31 = [ GEDIMAPH2345, DDBJAB605415 ]
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GEDIMAP IDP1320 (個体群)
個体群名R_atremius_atremius_Kumamoto_Ki
魚種カゼトゲタナゴ Rhodeus atremius atremius (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (菊池川水系)
解析領域ND1 (975 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Miyake, T., J. Nakajima, N. Onikura, S. Ikemoto, K. Iguchi, A. Komaru and K. Kawamura (2011) The genetic status of two subspecies of Rhodeus atremius, an endangered bitterling in Japan. Conserv. Genet., 12:383-400 GEDIMAPR463
多様度指数A:5, ne:3.85, h:0.8222, SE_h:0.0969, pi:0.001641, SE_pi:0.037001

B12 = [ GEDIMAPH2090, DDBJAB543647 ] ; B13 = [ GEDIMAPH2091, DDBJAB543648 ] ; B14 = [ GEDIMAPH2092, DDBJAB543649 ] ; B15 = [ GEDIMAPH2093, DDBJAB543650 ] ; B16 = [ GEDIMAPH2094, DDBJAB543651 ]
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GEDIMAP IDP1319 (個体群)
個体群名R_atremius_atremius_Kumamoto_Mi
魚種カゼトゲタナゴ Rhodeus atremius atremius (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (緑川水系)
解析領域ND1 (975 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Miyake, T., J. Nakajima, N. Onikura, S. Ikemoto, K. Iguchi, A. Komaru and K. Kawamura (2011) The genetic status of two subspecies of Rhodeus atremius, an endangered bitterling in Japan. Conserv. Genet., 12:383-400 GEDIMAPR463
多様度指数A:2, ne:1.69, h:0.4762, SE_h:0.1713, pi:0.000977, SE_pi:0.049881

A2 = [ GEDIMAPH2071, DDBJAB543628 ] ; A3 = [ GEDIMAPH2072, DDBJAB543629 ]
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GEDIMAP IDP1318 (個体群)
個体群名R_atremius_atremius_Kumamoto_Ku
魚種カゼトゲタナゴ Rhodeus atremius atremius (コイ科) fish base BOLD
場所熊本県 (球磨川水系)
解析領域ND1 (975 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Miyake, T., J. Nakajima, N. Onikura, S. Ikemoto, K. Iguchi, A. Komaru and K. Kawamura (2011) The genetic status of two subspecies of Rhodeus atremius, an endangered bitterling in Japan. Conserv. Genet., 12:383-400 GEDIMAPR463
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

A1 = [ GEDIMAPH2070, DDBJAB543627 ]
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GEDIMAP IDP1237 (個体群)
個体群名L_petersii_Kumamoto_15_SW
魚種シロウオ Leucopsarion petersii (ハゼ科) fish base BOLD
場所熊本県 新和 (その他水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報汽水
移植状況自然分布
出典Kokita, T. and K. Nohara (2011) Phylogeography and historical demography of the anadromous fish Leucopsarion petersii in relation to geological history and oceanography around the Japanese Archipelago. Molecular Ecology, 20: 143-164. GEDIMAPR431
多様度指数A:4, ne:3.57, h:0.9000, SE_h:0.1610, pi:0.004207, SE_pi:0.000000

H50 = [ GEDIMAPH1921, DDBJAB562205 ] ; H51 = [ GEDIMAPH1922, DDBJAB562206 ] ; H52 = [ GEDIMAPH1923, DDBJAB562207 ] ; H53 = [ GEDIMAPH1924, DDBJAB562208 ]

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