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GEDIMAP IDP2233 (個体群)
個体群名T_hakonensis_19_Kinu
魚種ウグイ Tribolodon hakonensis (コイ科) fish base BOLD
場所茨城県 (鬼怒川水系)
解析領域cyt_b (758 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., H. Sakai, T. Sanada and M. Nishida (2018) Comparative phylogeography of diadromous and freshwater daces of the genus Tribolodon (Cyprinidae). Ichthyol Res., 65 GEDIMAPR603
多様度指数A:3, ne:2.00, h:0.6000, SE_h:0.2152, pi:0.000880, SE_pi:0.000000

h06 = [ GEDIMAPH3864, DDBJLC277460 ] ; h07 = [ GEDIMAPH3865, DDBJLC277476 ] ; h08 = [ GEDIMAPH3866, DDBJLC277461 ]
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GEDIMAP IDP2209 (個体群)
個体群名T_brandtii_20_Kasumigaura
魚種マルタ Tribolodon brandtii (コイ科) fish base BOLD
場所茨城県 (利根川水系)
解析領域cyt_b (758 bp)
環境情報自然湖(大規模)
移植状況自然分布
出典Watanabe, K., H. Sakai, T. Sanada and M. Nishida (2018) Comparative phylogeography of diadromous and freshwater daces of the genus Tribolodon (Cyprinidae). Ichthyol Res., 65 GEDIMAPR603
多様度指数A:2, ne:1.60, h:0.5000, SE_h:0.2652, pi:0.003298, SE_pi:0.000000

bm01 = [ GEDIMAPH3836, DDBJLC277336 ] ; bm03 = [ GEDIMAPH3838, DDBJLC277342 ]
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GEDIMAP IDP1849 (個体群)
個体群名O_platypus_Ibaraki_Hishiki
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所茨城県 (利根川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR573
多様度指数A:3, ne:2.00, h:0.6000, SE_h:0.2152, pi:0.003320, SE_pi:0.000000

EJ13 = [ GEDIMAPH3233, DDBJLC019917 ] ; EJ16 = [ GEDIMAPH3236, DDBJLC019920 ] ; EJ48 = [ GEDIMAPH3268, DDBJLC019952 ]
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GEDIMAP IDP1848 (個体群)
個体群名O_platypus_Ibaraki_Amanogawa
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所茨城県 (利根川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR573
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

EJ13 = [ GEDIMAPH3233, DDBJLC019917 ]
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GEDIMAP IDP1739 (個体群)
個体群名HNY
魚種サクラマス類 Oncorhynchus masou complex (サケ科) fish base BOLD
場所茨城県 (その他水系)
解析領域CR (999 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Takahashi, H., T. Kondou, N. Takeshita, T-H. Hsu and M. Nishida (2015) Evolutionary process of iwame, a markless form of the red-spotted masu salmon Oncorhynchus masou ishikawae, in the Ono River, Kyushu. Ichthyol. Res. Online First. GEDIMAPR571
多様度指数A:3, ne:2.57, h:0.7333, SE_h:0.1552, pi:0.001134, SE_pi:0.000000

Hap1 = [ GEDIMAPH2912 ] ; Hap3 = [ GEDIMAPH2911 ] ; Hap7 = [ GEDIMAPH2913 ]
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GEDIMAP IDP1718 (個体群)
個体群名C_sp__Ibaraki_Hanazono_HN
魚種カジカ(回遊型) Cottus reinii (カジカ科) fish base BOLD
場所茨城県 (その他水系)
解析領域CR (386 bp)
環境情報河川下流
移植状況自然分布
出典Tsukagoshi, H., K. Sakai, K. Yamamoto and A. Goto (2013) Non-indigenous amphidromous sculpin Cottus pollux small-egg type (Teleostei: Cottidae) detected in rivers entering the Sea of Japan off Honshu Island, Japan. Ichthyol. Res., 60:93-97. GEDIMAPR537
多様度指数A:2, ne:1.92, h:0.6000, SE_h:0.1753, pi:0.001554, SE_pi:0.000000

S4 = [ GEDIMAPH2875, DDBJAB668989 ] ; S6 = [ GEDIMAPH2876, DDBJAB668990 ]
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GEDIMAP IDP1606 (個体群)
個体群名A_rivularis_Ibaraki_Hitachi_HS_J2
魚種ツチフキ Abbottina rivularis (コイ科) fish base BOLD
場所茨城県 常陸太田 (久慈川水系)
解析領域cyt_b (1052 bp)
環境情報不明
移植状況明らかに移植個体群である(国内移入)
出典 未発表データ: GEDIMAPR508
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

AR-h57 = [ GEDIMAPH2739, DDBJJX137559,JX137560,JX137561,JX137562,JX137563,JX137564,JX137565,JX137566,JX137567,JX137568,JX137569,JX137570,JX137571,JX137572,JX137573,JX137574,JX137599,JX137602 ]
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GEDIMAP IDP1590 (個体群)
個体群名Kuji_River
魚種カジカ(回遊型) Cottus reinii (カジカ科) fish base BOLD
場所茨城県 (久慈川水系)
解析領域CR (386 bp)
環境情報河川下流
移植状況自然分布
出典Yokoyama, R. and S. Yamamoto (2012) Freshwater sculpin dwelling in Lake Chuzenji, Nikko, Kanto District, Japan, is identified as Utsusemikajika, Cottus reinii, unintentionally introduced from Lake Biwa. Ichthyol Res., 49: 389-393. GEDIMAPR506
多様度指数A:2, ne:1.22, h:0.1895, SE_h:0.1081, pi:0.000491, SE_pi:0.014541

C = [ GEDIMAPH2695, DDBJAB724218 ] ; D = [ GEDIMAPH2696, DDBJAB724219 ]
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GEDIMAP IDP1526 (個体群)
個体群名P_fulvidraco_Ibaraki_Kasumigaura
魚種コウライギギ Pseudobagrus fulvidraco (ギギ科) fish base BOLD
場所茨城県 行方市,稲敷市 (利根川水系)
解析領域COI, CR (1036 bp)
環境情報自然湖(大規模)
移植状況外来種である(国外移入)
出典荒山和則・松崎慎一郎・増子勝男・萩原富司・諸澤崇裕・加納光樹・渡辺勝敏 (2012) 霞ケ浦における外来種コウライギギ(ナマズ目ギギ科)の採集記録と定着のおそれ. 魚類学雑誌,59:141-146 GEDIMAPR498
多様度指数A:2, ne:1.60, h:0.5000, SE_h:0.2652, pi:0.000483, SE_pi:0.000000

COI_1_CR_S = [ GEDIMAPH2502 ] ; COI_2_CR_Q = [ GEDIMAPH2503 ]
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GEDIMAP IDP1297 (個体群)
個体群名R_ocellatus_ocellatus_Ibaraki
魚種タイリクバラタナゴ Rhodeus ocellatus ocellatus (コイ科) fish base BOLD
場所茨城県 (利根川水系)
解析領域ND1 (975 bp)
環境情報不明
移植状況外来種である(国外移入)
出典三宅琢也・河村功一・細谷和海・岡崎登志夫・北川忠生 (2007) 奈良県内で確認されたニッポンバラタナゴ. 魚類学雑誌, 54(2): 225-230 GEDIMAPR286
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

AB292619 = [ GEDIMAPH2053, DDBJAB292619 ]
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GEDIMAP IDP1266 (個体群)
個体群名C_auratus_langsdorfii_Ibaraki_KSM
魚種ギンブナ Carassius auratus langsdorfii (コイ科) fish base BOLD
場所茨城県 (その他水系)
解析領域CR (321 bp)
環境情報自然湖(大規模)
移植状況自然分布
出典Yamamoto, G., M. Takada, K. Iguchi and M. Nishida (2010) Genetic constitution and phylogenetic relationships of Japanese crucian carps (Carassius). Ichthyol. Res., 57: 215-222. GEDIMAPR411
多様度指数A:3, ne:3.00, h:1.0000, SE_h:0.2722, pi:0.049844, SE_pi:0.000000

AB079921 = [ GEDIMAPH2002, DDBJAB079921 ] ; AB079922 = [ GEDIMAPH1999, DDBJAB079922 ] ; AB079923 = [ GEDIMAPH1997, DDBJAB079923 ]
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GEDIMAP IDP1251 (個体群)
個体群名L_petersii_Ibaraki_29_HT
魚種シロウオ Leucopsarion petersii (ハゼ科) fish base BOLD
場所茨城県 日立 (久慈川水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報汽水
移植状況自然分布
出典Kokita, T. and K. Nohara (2011) Phylogeography and historical demography of the anadromous fish Leucopsarion petersii in relation to geological history and oceanography around the Japanese Archipelago. Molecular Ecology, 20: 143-164. GEDIMAPR431
多様度指数A:5, ne:5.00, h:1.0000, SE_h:0.1265, pi:0.013146, SE_pi:0.000000

H10 = [ GEDIMAPH1881, DDBJAB562165 ] ; H110 = [ GEDIMAPH1981, DDBJAB562265 ] ; H111 = [ GEDIMAPH1982, DDBJAB562266 ] ; H112 = [ GEDIMAPH1983, DDBJAB562267 ] ; H113 = [ GEDIMAPH1984, DDBJAB562268 ]
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GEDIMAP IDP937 (個体群)
個体群名O_latipes_Ibaraki_Mito1
魚種メダカ Oryzias latipes (メダカ科) fish base BOLD
場所茨城県 水戸市 (那珂川水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Takehana, Y., N. Nagai, M. Matsuda, K. Tsuchiya, and M. Sakaizumi (2003) Geographic variation and diversity of the cytochrome b gene in Japanese wild populations of medaka, Oryzias latipes. Zool. Sci., 20: 1279-1291 GEDIMAPR199
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

B11_Mito1 = [ GEDIMAPH1473, DDBJAB084710 ]
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GEDIMAP IDP880 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_Ibaraki_Nugurasawa_13
魚種イワナ類 Salvelinus leucomaenis (サケ科) fish base BOLD
場所茨城県 (利根川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典山本祥一郎・中村智幸・久保田仁志・土居隆秀・北野聡・長谷川功 (2008) ミトコンドリア DNA 分析に基づく関東地方産イワナの遺伝的集団構造. 日本水産学会誌,74: 861-863. GEDIMAPR361
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap3 = [ GEDIMAPH554 ]
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GEDIMAP IDP867 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_Kuji_1
魚種イワナ類 Salvelinus leucomaenis (サケ科) fish base BOLD
場所茨城県 (久慈川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典山本祥一郎・中村智幸・久保田仁志・土居隆秀・北野聡・長谷川功 (2008) ミトコンドリア DNA 分析に基づく関東地方産イワナの遺伝的集団構造. 日本水産学会誌,74: 861-863. GEDIMAPR361
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap3 = [ GEDIMAPH554 ]
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GEDIMAP IDP742 (個体群)
個体群名T_brevispinis_Ibaraki_Hinuma
魚種ヌマチチブ Tridentiger brevispinis (ハゼ科) fish base BOLD
場所茨城県 広浦 (那珂川水系)
解析領域cyt_b (322 bp)
環境情報自然池沼
移植状況自然分布
出典Mukai, T., K. Naruse, and M. Morisawa (2000) Natural hybridization and gene flow between two Tridentiger gobies in Lake Hinuma (Ibaraki Prefecture, Japan) . Ichthyol. Res., 47(2): 175-181 GEDIMAPR146
多様度指数A:7, ne:3.92, h:0.8022, SE_h:0.0936, pi:0.004914, SE_pi:0.052109

A = [ GEDIMAPH176, DDBJAB212292 ] ; B = [ GEDIMAPH185, DDBJAB212301 ] ; C = [ GEDIMAPH172, DDBJD89581 ] ; D = [ GEDIMAPH184, DDBJAB212300 ] ; E = [ GEDIMAPH175, DDBJD89585 ] ; F = [ GEDIMAPH165, DDBJD89574 ] ; G = [ GEDIMAPH189, DDBJAB212305 ]
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GEDIMAP IDP741 (個体群)
個体群名T_obscura_x_brevispinis_Backcross2_Ibaraki_Hinuma
魚種チチブxヌマチチブ交雑個体 Tridentiger obscura x brevispinis (ハゼ科) fish base BOLD
場所茨城県 広浦 (那珂川水系)
解析領域cyt_b (322 bp)
環境情報自然池沼
移植状況自然分布
出典Mukai, T., K. Naruse, and M. Morisawa (2000) Natural hybridization and gene flow between two Tridentiger gobies in Lake Hinuma (Ibaraki Prefecture, Japan) . Ichthyol. Res., 47(2): 175-181 GEDIMAPR146
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

F = [ GEDIMAPH165, DDBJD89574 ]
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GEDIMAP IDP740 (個体群)
個体群名T_obscura_x_brevispinis_F1_Ibaraki_Hinuma
魚種チチブxヌマチチブ交雑個体 Tridentiger obscura x brevispinis (ハゼ科) fish base BOLD
場所茨城県 広浦 (那珂川水系)
解析領域cyt_b (322 bp)
環境情報自然池沼
移植状況自然分布
出典Mukai, T., K. Naruse, and M. Morisawa (2000) Natural hybridization and gene flow between two Tridentiger gobies in Lake Hinuma (Ibaraki Prefecture, Japan) . Ichthyol. Res., 47(2): 175-181 GEDIMAPR146
多様度指数A:3, ne:2.46, h:0.6786, SE_h:0.1220, pi:0.002551, SE_pi:0.059870

D = [ GEDIMAPH184, DDBJAB212300 ] ; E = [ GEDIMAPH175, DDBJD89585 ] ; F = [ GEDIMAPH165, DDBJD89574 ]
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GEDIMAP IDP739 (個体群)
個体群名T_obscura_x_brevispinis_backcross1_Ibaraki_Hinuma
魚種チチブxヌマチチブ交雑個体 Tridentiger obscura x brevispinis (ハゼ科) fish base BOLD
場所茨城県 広浦 (那珂川水系)
解析領域cyt_b (322 bp)
環境情報自然池沼
移植状況自然分布
出典Mukai, T., K. Naruse, and M. Morisawa (2000) Natural hybridization and gene flow between two Tridentiger gobies in Lake Hinuma (Ibaraki Prefecture, Japan) . Ichthyol. Res., 47(2): 175-181 GEDIMAPR146
多様度指数A:3, ne:2.67, h:0.8333, SE_h:0.2224, pi:0.013458, SE_pi:0.000000

F = [ GEDIMAPH165, DDBJD89574 ] ; G = [ GEDIMAPH189, DDBJAB212305 ] ; H = [ GEDIMAPH164, DDBJD89573 ]
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GEDIMAP IDP738 (個体群)
個体群名T_obscurus_Ibaraki_Hinuma
魚種チチブ Tridentiger obscurus (ハゼ科) fish base BOLD
場所茨城県 広浦 (那珂川水系)
解析領域cyt_b (322 bp)
環境情報自然池沼
移植状況自然分布
出典Mukai, T., K. Naruse, and M. Morisawa (2000) Natural hybridization and gene flow between two Tridentiger gobies in Lake Hinuma (Ibaraki Prefecture, Japan) . Ichthyol. Res., 47(2): 175-181 GEDIMAPR146
多様度指数A:3, ne:2.60, h:0.6667, SE_h:0.0782, pi:0.009715, SE_pi:0.076016

F = [ GEDIMAPH165, DDBJD89574 ] ; G = [ GEDIMAPH189, DDBJAB212305 ] ; H = [ GEDIMAPH164, DDBJD89573 ]

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