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GEDIMAP IDP1850 (個体群)
個体群名O_platypus_Saitama_Oppe
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所埼玉県 (荒川水系)
解析領域cyt_b (1004 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典 未発表データ: GEDIMAPR573
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

EJ13 = [ GEDIMAPH3233, DDBJLC019917 ]
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GEDIMAP IDP1277 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_pluvius_Yamanashi_AR
魚種ニッコウイワナ Salvelinus leucomaenis pluvius (サケ科) fish base BOLD
場所埼玉県 (荒川水系)
解析領域CR (517 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Yamaguchi, K., M. Nakajima and N. Taniguchi (2010) Loss of genetic variation and increased population differentiation in geographically peripheral populations of Japanese char Salvelinus leucomaenis. Aquaculture, 308: S20-S27 GEDIMAPR443
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap-7 = [ GEDIMAPH2029 ]
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GEDIMAP IDP1203 (個体群)
個体群名T_tanago_Saitama_Namegawa_captive
魚種ミヤコタナゴ Tanakia tanago (コイ科) fish base BOLD
場所埼玉県 滑川市 (荒川水系)
解析領域cyt_b (614 bp)
環境情報自然池沼
移植状況飼育集団
出典Kubota, H., K. Watanabe, N. Suguro, M. Tabe, K. Umezawa and S. Watanabe (2010) . Conserv. Genet. GEDIMAPR413
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hpt2 = [ GEDIMAPH1813, DDBJAB457622 ]
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GEDIMAP IDP1202 (個体群)
個体群名T_tanago_Saitama_Tokorozawa_captive
魚種ミヤコタナゴ Tanakia tanago (コイ科) fish base BOLD
場所埼玉県 所沢市 (荒川水系)
解析領域cyt_b (614 bp)
環境情報小水路
移植状況飼育集団
出典Kubota, H., K. Watanabe, N. Suguro, M. Tabe, K. Umezawa and S. Watanabe (2010) . Conserv. Genet. GEDIMAPR413
多様度指数A:2, ne:1.98, h:0.5123, SE_h:0.0311, pi:0.001669, SE_pi:0.024810

Hpt2 = [ GEDIMAPH1813, DDBJAB457622 ] ; Hpt6 = [ GEDIMAPH1815, DDBJAB457626 ]
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GEDIMAP IDP941 (個体群)
個体群名O_latipes_Saitama_Yoshimi
魚種メダカ Oryzias latipes (メダカ科) fish base BOLD
場所埼玉県 比企郡吉見町 (荒川水系)
解析領域cyt_b (1141 bp)
環境情報不明
移植状況自然分布
出典Takehana, Y., N. Nagai, M. Matsuda, K. Tsuchiya, and M. Sakaizumi (2003) Geographic variation and diversity of the cytochrome b gene in Japanese wild populations of medaka, Oryzias latipes. Zool. Sci., 20: 1279-1291 GEDIMAPR199
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

B1a_Yoshim = [ GEDIMAPH1457, DDBJAB084693 ]
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GEDIMAP IDP889 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_Saitama_Irikawa_28
魚種イワナ類 Salvelinus leucomaenis (サケ科) fish base BOLD
場所埼玉県 (荒川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典山本祥一郎・中村智幸・久保田仁志・土居隆秀・北野聡・長谷川功 (2008) ミトコンドリア DNA 分析に基づく関東地方産イワナの遺伝的集団構造. 日本水産学会誌,74: 861-863. GEDIMAPR361
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap22 = [ GEDIMAPH573 ]
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GEDIMAP IDP888 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_Saitama_Ooboragawa_26
魚種イワナ類 Salvelinus leucomaenis (サケ科) fish base BOLD
場所埼玉県 (荒川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典山本祥一郎・中村智幸・久保田仁志・土居隆秀・北野聡・長谷川功 (2008) ミトコンドリア DNA 分析に基づく関東地方産イワナの遺伝的集団構造. 日本水産学会誌,74: 861-863. GEDIMAPR361
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap22 = [ GEDIMAPH573 ]
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GEDIMAP IDP686 (個体群)
個体群名M_salmoides_Saitama_Tennou_30_Sa
魚種オオクチバス Micropterus salmoides (サンフィッシュ科) fish base BOLD
場所埼玉県 小川 (荒川水系)
解析領域CR (294 bp)
環境情報溜池・小規模ダム
移植状況外来種である(国外移入)
出典高村健二 (2005) 日本産ブラックバスにおけるミトコンドリアDNAハプロタイプの分布. 魚類学雑誌,52:107−114 GEDIMAPR235
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

h_AB190245 = [ GEDIMAPH1060, DDBJAB190245 ]
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GEDIMAP IDP680 (個体群)
個体群名M_salmoides_Tochigi_Higashiarakawa_24_To-4
魚種オオクチバス Micropterus salmoides (サンフィッシュ科) fish base BOLD
場所栃木県 (荒川水系)
解析領域CR (294 bp)
環境情報ダム湖
移植状況外来種である(国外移入)
出典高村健二 (2005) 日本産ブラックバスにおけるミトコンドリアDNAハプロタイプの分布. 魚類学雑誌,52:107−114 GEDIMAPR235
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

c_AB190240 = [ GEDIMAPH1055, DDBJAB190240 ]
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GEDIMAP IDP677 (個体群)
個体群名M_salmoides_Tochigi_Ara_21_To-1
魚種オオクチバス Micropterus salmoides (サンフィッシュ科) fish base BOLD
場所栃木県 (荒川水系)
解析領域CR (294 bp)
環境情報河川中流
移植状況外来種である(国外移入)
出典高村健二 (2005) 日本産ブラックバスにおけるミトコンドリアDNAハプロタイプの分布. 魚類学雑誌,52:107−114 GEDIMAPR235
多様度指数A:2, ne:2.00, h:1.0000, SE_h:0.5000, pi:0.003401, SE_pi:0.000000

b_AB190239 = [ GEDIMAPH1054, DDBJAB190239 ] ; c_AB190240 = [ GEDIMAPH1055, DDBJAB190240 ]
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GEDIMAP IDP579 (個体群)
個体群名S_leucomaenis_pluvius_Tokyo_Ara_PU-4
魚種ニッコウイワナ Salvelinus leucomaenis pluvius (サケ科) fish base BOLD
場所東京都 (荒川水系)
解析領域cyt_b (557 bp)
環境情報河川上流
移植状況自然分布
出典Yamamoto, S., K. Morita, S. Kitano, K. Watanabe, I. Koizumi, K. Maekawa and K. Takamura (2004) Phylogeography of white-spotted charr (Salvelinus leucomaenis) inferred from mitochondrial DNA sequences. Zool. Sci. 21: 229-240 GEDIMAPR213
多様度指数A:1, ne:1.00, h:0.0000, SE_h:0.0000, pi:0.000000, SE_pi:0.000000

Hap22 = [ GEDIMAPH573 ]
全詳細
GEDIMAP IDP120 (個体群)
個体群名Z_platypus_Ara
魚種オイカワ Zacco platypus (コイ科) fish base BOLD
場所東京都 (荒川水系)
解析領域CR (496 bp)
環境情報河川中流
移植状況明らかに移植個体群である(国内移入)
出典Ma, G.-C., K. Watanabe, H.-S. Tsao and H.-T. Yu (2006) Mitochondrial phylogeny reveals the artificial introduction of the pale chub Zacco platypus (Cyprinidae) in Taiwan. Ichthyol. Res., 53: 323-329 GEDIMAPR278
多様度指数A:6, ne:4.57, h:0.8929, SE_h:0.1113, pi:0.013969, SE_pi:0.140651

J18 = [ GEDIMAPH219, DDBJDQ377736 ] ; J19 = [ GEDIMAPH220, DDBJDQ377737 ] ; J20 = [ GEDIMAPH221, DDBJDQ377738 ] ; J21 = [ GEDIMAPH222, DDBJDQ377739 ] ; J22 = [ GEDIMAPH223, DDBJDQ377740 ] ; J3 = [ GEDIMAPH204, DDBJDQ377721 ]

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